对经济特区内生产企业申请自荐进出口经营权试行自动登记制，经济特区的生产企业，注册资本200万元以上，并已投入生产，均可向当地外经贸主管部门申请登记，外经贸主管部门应在15个工作日内对符合条件的生产企业予以登记，即取得出口自产产品和进口生产所需的机械设备、原辅材料的进出口经营权，可按规定到海关、商检、外汇、工商、税务等管理部门办理有关手续。生产企业在申请自营进出口权的过程中，对外经贸主管部门的决定不服，可根据《行政复议条例》向外经贸部申请复议。
对经济特区内除生产企业以外的其他企业申请进出口经营权，试行由外经贸部总量控制，经济特区自行审批的办法。
各经济特区外经贸主管部门按照外经贸部规定的必要条件和标准，自行审批在经济特区内从事进出口业务的外贸企业，并报外经贸部备案。外经贸部已核准五个经济特区1996年的总量为2013家。
科研院所申请进出口权须履行以下程序：各部门直属科研院所应向其主管部门提出书面申请，由主管部门送科技部和外经贸部；地方科研院所向所在省、自治区、直辖市及计划单列市经贸厅（委）和科委提出书面申请，由经贸厅（委）和科委负责审查，取得一致意见后联合报科技部和外经贸部。科技部对各部门、各地区报送的科研院所进行审查后，提出审查意见分批送外经贸部，外经贸部根据科技部的审查意见，进行审核批复。
进出口权原则上直接赋予科研院所，不另外批准成立新的进出口公司。科研院所已有企业法人营业执照的，进出口权直接授予该单位；科研院所本身没有企业法人营业执照的．对外经营权可根据申请单位要求授予的一家直属全资全民所有制企业。
赋予商业、物资企业进出口经营权的主要目的是为了深化流通体制改革，扩大对外开放，增强国有大中型商业、物资企业活力，加快发展第三产业。根据领导同志的批示精神，赋予商业、物资企业进出口经营权工作已从试点阶转入正常审批
部门直属企业及沿海地区物资企业、商业批发企业年销售额在10亿元人民币以上，内地物资企业、商业批发企业年销售额在3亿元人民币以上；
经批准取得自营进出口权的私营生产企业或科研院所，凭批准文件到海关、出入境检验、外汇、工商、税务等部门办理有关手续，向省、自治区、直辖市及计划单列市外经贸主管部门申领《进出口企业资格证书》后开展自营进出口业务。取得自营进出口权的私营生产企业或科研院所分立、合并、变更自营进出口商品目录，须报外经贸部批准
积极出口创汇。
第八条各级外经贸主管部门对取得自营进出口权的私营生产企业或科研院所开展进出口业务，要积极支持，加强指导，做好服务和规范化管理工作。
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