有机废弃物，包含人畜粪便、餐余垃圾、污水处理厂的副产品污泥、瓜果蔬菜市场废弃的烂瓜果烂菜叶等等，其年产量是同期工业固体废弃物产量的10倍，量大且集中，如不及时处理将带来严重的环境污染。对有机废弃物进行堆肥化处理(好氧发酵)可以实现废物的资源化利用，因此获得了广泛的应用，人们尝试着开发了众多的好氧发酵反应器，试图提高好氧发酵的效率，降低发酵设备的制造成本和运行成本。
目前，国内现有的一些畜禽粪便发酵技术普遍存在着发酵，远距离运输，集中处理高成本的问题。同时因为发酵工艺落后，占地面积大，发酵过程中因发酵工艺落后造成地下水的污染和因发酵不全产生的气味，使蚊蝇滋生对周围环境产生严重影响。同时发酵生产受气候影响严重，雨雪天无常工作，冬季因低温导致设备无法处理粪便的现象。发酵时间普遍长达1-2个月，耗费工作人员数量多。
菌肥是一种以菌类为基础的肥料，主要由菌丝体、孢子体和菌体等组成。菌肥可分为两大类：一类是以菌丝体为主要成分，如木霉菌肥、腐霉菌肥等；另一类是以菌体和孢子体为主要成分，如果霉菌肥、曲霉菌肥等。 菌肥具有以下特点：
1. 富含有机质：菌肥主要由菌类生物转化而来，富含有机质，能够提供植物所需的营养元素。
2. 促进土壤活性：菌肥中的菌类有利于土壤微生物的繁殖和活动，促进土壤的生物学活性。
3. 改善土壤结构：菌肥能够分解有机物质，改善土壤结构，增加土壤通气性和保水能力。
4. 提高植物力：菌肥中的菌类具有一定的抗病能力，能够提高植物的力，减少病害发生。
菌肥的使用方法：
1. 施用量：一般情况下，每亩土地使用菌肥的量为10-15公斤。
2. 施用时间：菌肥可与基肥一同施用，也可作为追肥使用。一般在种植前2-3周施用，或者在植物生长期间按需追肥。
3. 施用方式：菌肥可直接撒在土壤表面，然后轻轻耕入土中，也可与底肥或追肥混合使用。
需要注意的是，菌肥的保存要避免阳光直射和高温环境，尽量保存在阴凉干燥处。此外，在施用菌肥时，应避免与农药等化学物质混用，以免发生不良反应。
微生物菌肥集生物菌、中草药、矿物质三效合一，从二十余味中草药及海藻中发酵出的多糖类、生物碱类、类、腐殖酸类、海藻素等生物活性成分，为作物补充高能量物质及功能性物质，能够开启并促进植物次生代谢。
微生物代谢物有直接杀菌的作用且进入土壤会在根际定殖，抢占生态位点让线虫及真无法侵染。有益微生物进入土壤会在根系周围产生大量粘多糖与植物分泌的粘液及矿物胶体、有机交替相结合，形成土壤团粒结构，提高土壤蓄肥、保水能
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