在一定的环境条件下，微生物通过代谢活动对饲料原料中的某些物质进行分解和转化，使原料中不易被牲畜和家禽利用的大分子物质转变成为易于消化吸收的小分子物质，同时，微生物得到增殖，由于微生物菌体的单细胞蛋白含量很高，因而提高了成品饲料的蛋白质含量，这就是广义的微生物蛋白饲料。另外若微生物菌种群中含有对牲畜和家禽具有益生功能的饲用微生物，则微生物蛋白饲料就会具有更好的饲喂效果。
微生物蛋白饲料的发酵方法发酵即通过微生物的代谢活动对原料中的有机物进行分解和转化的过程。微生物蛋白饲料的发酵方式主要有固态发酵和液态发酵两种工艺体系。固态发酵是以气相为连续相的生物反应过程，是指在没有或几乎没有自由水存在的条件下，在有一定湿度的水不溶性固体基质中，用一种或几种微生物进行发酵的一个生物反应过程；液态发酵是以液相为连续相的生物反应过程。由于固态发酵具有产率高、周期短、能耗低等特点，因而日益受到重视。
微生物易于变异，可通过各种物理、化学方法进行诱变，或采用基因重组技术对单细胞蛋白菌种进行遗传性状的改变，从而较易获得高产的突变株。
我国饲料资源短缺，尤其是蛋白饲料严重缺乏，根据蛋白质饲料来源不同可分为植物性蛋白饲料、动物性蛋白饲料、单细胞蛋白饲料和非蛋白氮饲料，植物性蛋白饲料原料以豆粕、棉籽粕、菜籽粕、花生粕、苜蓿、玉米加工的副产品玉米蛋白粉等草本饲料为主，动物性蛋白饲料原料有鱼粉、肉骨粉、羽毛粉等，单细胞蛋白饲料是由单细胞生物个体组成的蛋白质含量较高的饲料，如酵母菌饲料和单细胞藻类饲料，非蛋白氮饲料一般指饲料用尿素等。
随着对环境污染、食品安全等日益重视，无抗、禁抗养殖推广，现代微生物发酵技术、生物工程日益发展，微生物发酵蛋白饲料具有了更为广阔的发展前景，微生物发酵蛋白饲料具有了多种功能，既可降低饲料成本、养殖成本，又可调节动物肠道菌群平衡，提高饲料利用率，改善动物生产性能和增强机体力。
植物蛋白来源广泛、供应稳定，价格远远低于动物蛋白和鱼粉，是良好鱼粉替代物。但由于其中抗营养因子的存在和氨基酸不平衡等因素，使得养殖对象的生理功能、肉质组分及生长率都会或多或少的受到影响。
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