海参体内富含人体必需的常量和微量元素，其中微量元素中铁、锌含量明显其它元素。铁和锌是人体需要量多的微量元素，铁是参与构成血红蛋白的主要组分。锌是200多种含锌酶的组成成分，在核酸和蛋白质代谢中有着重要的作用，尤其与脑及智力的发育有着密切的关系。
不同的涨发方式会造成海参干品中营养物质的流失。常温水发造成铜、铁、锌、钙、镁、磷的损失率在73.25%-73.81%之间，高温水发的损失率为92.17%-92.95%，常温碱发时的损失率为76.79%（除镁离子以外），其它化学元素损失率均在93.38%-95.24%。另外，三种涨发方式均会造成海参干品中赖氨酸、组氨酸和精氨酸的流失，常温水发赖氨酸损失率为61.63%，高温水发为72.61%，常温碱发为79.46%，组氨酸的损失率依次为15.24%、52.86%、35.71%，精氨酸依次为26.11%、54.68%、70.14%。
牡蛎以其味道鲜美、营养丰富而深受消费者喜爱，但在人们食用时，大量的贝壳作为垃圾丢弃。实际上牡蛎壳中含有90%以上的碳酸钙是一种宝贵资源，可应用于诸多领域，如制作各种添加剂等。
密鳞牡蛎具有富含牛磺酸(50µmol/g)、锌、硒的特点；低脂肪、低胆固醇，含有一定量的高度不饱和脂肪酸(EPA+DHA占脂肪总量的20.4%)，无机盐、维生素含量也很丰富。吴成业等进行了太平洋牡蛎、僧帽牡蛎和近江牡蛎中游离氨基酸和牛磺酸的分析。三者中皆含有人体所有8种必需氨基酸,其中含量高的都是赖氨酸,这对平衡国民膳食中氨基酸比例具有重要意义。三种牡蛎中牛磺酸的含量分别高达7.542，4.388和3.591mg/g，几乎超过其他游离氨基酸含量的总和。同时，发现牡蛎中游离氨基酸的含量随着季节的不同而异。
牡蛎肉中含大量糖原，糖原是细胞进行新陈代谢的能源，补充糖原可改善机体心脏及血液循环功能，并能增进肝脏的功能且具有保肝作用。牡蛎中的糖原还可直接为机体吸收利用，从而能减轻胰腺负担。
牡蛎中检测出的关键挥发性物质（ROAV≥1）主要有醛类（11种）、醇类（2种）、酮类（2种）和二甲基硫物质，它们综合体现了新鲜牡蛎的特征气味如黄瓜味、蘑菇味、青草味、坚果味、脂肪味、油脂味等。
