离子交换树脂应为不溶性物质。但树脂在合成过程中夹杂的聚合度较低的物质，及树脂分解生成的物质，会在工作运行时溶解出来。交联度较低和含活性基团多的树脂，溶解倾向较大。
离子交换树脂含有大量亲水基团，与水接触即吸水膨胀。当树脂中的离子变换时，如阳离子树脂由H+转为Na+，阴树脂由Cl-转为OH-，都因离子直径增大而发生膨胀，增大树脂的体积。通常，交联度低的树脂的膨胀度较大。在设计离子交换装置时，考虑树脂的膨胀度，以适应生产运行时树脂中的离子转换发生的树脂体积变化。
阳、阴树脂都有被污染的问题，但是这两种树脂铁污染的机理却不相同。除盐设备中阳树脂接触的是原水中和铁离子、铁凝聚过的产物和腐蚀产物。水中的铁离子被阳树脂吸收后，较难再生出来，腐蚀产物在再生时反而变为铁离子，在较低的再生剂量下，还会被出水端树脂吸收。铁离子污染，会使颜色变深、加速氧化降解、性能逐渐降低、出水水质恶化水量减少；阴树脂受铁污染情况则不同，往往是由再生液带入的铁沉积在阴树脂上，并和硅、有机物等结合在一起成为一种复杂的物质形态使阴树脂受污染，而且这种污染是累积式的。
