杀菌灭藻剂的使用可以有效改善水体环境和增加水的透明度，不会造成污染现象，为了达到良好的使用效果，在使用时需要足以几个注意问题。
1、将杀菌灭藻剂直接或与水混合后撒入水中。对大量交换水体，可以手工或者使用特殊的定量设备将产品撒入水流入口处，投加可以是连续的，也可以是在经过特殊的活化池处理后加入。
2、使用的时间根据水质参数而确定。为了水环境的改善，对于没有水交换的湖泊，可以集中在一年中的许多时间段内使用；对于有河流、小溪或者其它大量水交换的水体，可以在较长的时间段内稀释使用。
3、水产养殖使用时根据水质污染程度而定使用量。建议使用前和相关技术人员进行沟通，以免使用过程中用量过大而浪费药剂，或者用量过少达不到效果。
菌藻类大量滋生繁殖，会带来一系列问题：
（一）产生大量微生物粘泥，使水质浊度升高，在换热设备低流速区如封头、列管、
填料等处积聚粘泥，造成堵塞、淤积等现象，影响换热器的传热效率
却效率。
（二）菌藻微生物在自身新陈代谢过程中产生各种类型酸性物质，引起系统设备的酸性腐蚀。
（三）微生物粘泥在金属设备表面不均匀沉积，会因氧浓差形成电池效应，引起垢下腐蚀。
（四）凉水塔壁及支柱及部分设备长满青苔，布满藻类粘泥，使循环水水质严重恶化。
在菌藻微生物快速滋生繁殖时，进行有效杀灭控制和干预，并改变其生存环境，是循环水系统进行杀菌灭藻处理的关键。
所以，电厂循环水处理主要包括缓蚀阻垢处理和杀菌灭藻、粘泥剥离处理。
加药注意事项：
（1）准确、按时、按量进行加药；
（2）采用间断排污时，应在排污之后加药；
（3）每次在配药前，均需将配药桶冲洗干净后，才能将药剂倒入配药桶中，且将药剂加完后均需对配药桶冲洗2~3次；
（4）如采用两种杀菌灭藻剂应交替投加，且加入时间间隔均匀分布；
（5）加入杀菌灭藻剂的当天不投加阻垢缓蚀剂；
（6）详细记录日常加药情况及排污置换情况。
根据系统现状和药剂特性，可将杀菌灭藻剂直接加入集水池中。阻垢缓蚀剂的加药方式为：在循环冷却水集水池旁配置一配药槽，配药槽上部有补水管，下部有排污口，药剂加入配药槽中用补充水稀释后，用计量泵连续均匀地逐渐加入集水池中
