在二手冷藏集装箱制冷装置运行过程中，蒸发器盘管上会形成冰层，这取决于设定温度、货物温度、通风装置的新风量和货物湿度。制冷装置会定期进入除霜状态，一系列电加热装置会产生热量或向蒸发器盘管内吹入热空气。此时所有风扇将停止旋转，以防止热空气进入货舱。但是，由于回风温度传感器位于制冷机组附近，因此可能会记录温度升高。因此，除非经过数据记录软件处理，否则温度记录会显示与除霜间隔一致的周期性温升。如果除霜时间很短，每小时的温度读数和除霜时间可能会有一些差异。
冷藏集装箱脱离制冷时间：各种运输方式之间的交接可能出现短途运输或制冷系统故障，造成停止制冷。对冷冻和冷藏保鲜货物短时间地停止制冷状态是允许的。许多产品出现几小时的停止制冷可以接受，但并非所有货物都如此。对任何冷藏货物均不允许出现长时间地停止制冷。对特种货物和温度灵敏货物应保持制冷系统连续工作，避免任何温度波动造成货物质量下降。
为了避免冷藏集装箱内壁面产生凝结水，可采取如下措施： 1． 如果箱内湿度正常，则应设法提高隔热壁的内部热阻（减小K值），或设法减小内表面的对流热阻，以提高内壁面的温度t2，例如增加箱内空气流速。 2． 如果箱内空气湿度很大时，采用上述方法是无效的。这时，应该在内壁面增加防水层，以免水分渗入隔热壁内部。 至于隔热壁内部结露，主要是由于箱内外水蒸气的压力差和隔热壁的渗透性造成的。由于隔热壁两侧空气温度的不同，即使两侧空气的湿度相等，温度高的一侧空气的水蒸气分压力也比温度低的一侧大。这样会产生水蒸气分压力差，此时水蒸气将从水蒸气分压力高的一侧通过隔热壁向分压力较低的一侧渗透。
