有些代理记账公司没有与委托单位签订正式的委托代理合同，对双方的权利、义务缺少明确的规定，在实际工作中遇到异议时，往往无法分清责任。因此在选择代账公司的时候，企业就要更加谨慎。
代理记账机构潜力未充分发挥。代理记账机构的数量在不断增加，但整体规模普遍较小，代理业务范围不宽。真正能提供受托单位会计核算、税收筹划、纳税申报、内部审计、工商税务注册年检、财税咨询等会计服务的机构很少。
代理记账机构执业质量不乐观。会计核算方面尚存在许多不规范之处，一些会计核算未能以权责发生制为基础，对所代理公司未按《公司法》计提法定公积金、法定公益金的现象也较普遍，代理编制的年度财务会计报告都只有基本会计报表，均未按制度规定的要求提供会计报表附注的内容等。
代理记账业务收费标准混乱。在收费标准上，各家代理记账机构悬殊较大，有些代理记账机构甚至通过进行恶意竞争，还有部分代理记账机构自身的经营收入核算不规范，隐匿收入现象也较普遍。
代理记账机构及其从业人员的义务： （1）按照委托合同办理代理记账业务，遵守有关法律、行政法规和国家统一的会计制度的规定； （2）对在执行业务中知悉的商业秘密应当保密； （3）对委托人示意其作出不当的会计处理，提供不实的会计资料，以及其他不符合法律、行政法规和国家统一的会计制度规定的要求，应当拒绝； （4）对委托人提出的有关会计处理原则问题应当予以解释。
业务范围 1、代理各个税种的纳税申报，代理企业纳税情况自查及清算各种税款业务; 2、代理企业整体税务安排、投资项目税收评估，代理制作涉税文书。 3、建立企业纳税核算体系用办税制度，为企业设计财务制度。 4、协助企业进行股份制改及企业间兼并、收购工作，代理设计经营管理制度。 5、为企业提供报表分析，提供其他管理建议。 6、委托人要求的其他常年代理业务。 有百分之九十八的代理记账机构会提供整理原始凭证、编制会计凭证、登记账册、编制会计报表、纳税申报五项基本服务。
