为接受认证机构的认证审核，组织应做好充分准备，保持体系有效运行。认证机构会派出审核组，审核组将对组织实施认证审核。认证审核包括阶段审核和第二阶段现场审核。在组织完成第二阶段现场审核开具的不符合纠正并经过审核组验证关闭后，机构经过认证评定，将确定是否批准组织的认证注册和颁发认证证书。认证证书有效期三年，三年内，组织要多次接受机构的监督审核；三年后，组织要申请复审，重新注册获得证书，此过程同次认证取证。
本标准规定了对环境管理体系的要求，使一个组织能够根据法律法规和它应遵守的其他要求，以及关于重要环境因素的信息，制定和实施环境方针与目标。它适用于那些组织确定为能够控制，或有可能施加影响的环境因素。但标准本身并未提出具体的环境绩效准则。
在实际操作中，实施ISO14001环境管理体系认证也有许多具体的步骤和方法。，企业需要了解并分析自身的环境因素，找出需要控制和改进的地方。其次，企业需要制定详细的环境管理计划和实施方案，明确责任和分工再次，企业需要定期进行环保检查和评估，确保环境管理体系的有效运行。后，企业还需要与认证机构合作，按照审核标准进行自查和整改，以达到认证要求。
