目前来看，高新技术服务费有两种主要模式 一、固定金额 即：双方就认定代办一事谈定一个固定的价格和确切的支付条件以及支付时间。使用这种支付方式的一般为老牌的正规机构。 二、比例提佣 即：企业通过认定，拿到相关补贴后。机构按照比例抽取一定的。至于比例，由双方商定。实用此类支付方式的，一般为近几年新成立的机构。因近年高企补贴大幅度提升。催生的新的机构和新的收费模式。
正确核算高新技术产品（服务）收入 按照技术转让合同和其他合同分明细项目进行核算，尽量与所进行的研究开发项目对应，归属哪个项目的收入就列在该项目名下，并且与非高新技术产品 (服务 )区别开。
国家优惠政策和好处： 1、国家可预计获得深圳各区15万—35万的资金奖励：南山区、宝安区15万；福田区、龙岗区、大鹏新区25万；罗湖区、龙华区、坪山区、盐田区、光明新区35万； 2、可享受国家税收优惠政策、企业所得税减免10%，降幅40%； 3、企业可在此基础上申请其它项目资助，可享受贴息和展会补贴等各项优惠政策。 4、国家资质是金字招牌和无形资产，赢得更多客户合作机会，更多融资并购机会。 国家认定的领域： 一、电子信息 二、生物与新医药 三、航空航天 四、新材料 五、高技术服务 六、新能源及节能 七、资源与环境 八、制造与自动化
