化粪池的应用已有100多年的历史，早起源于19世纪的欧洲。初，在城市生活区内设置化粪池的目的是为了积取肥料。然而，随着城市化的进展和环境污染问题的加剧，化粪池在保护水体方面发挥了越来越重要的作用。如今，在许多大城市中，化粪池为农业生产提供肥料的功能已逐渐淡化，它更多地被视
流入第三池的粪液一般已经腐熟，其中病菌和寄生虫卵已基本杀灭。第三池功能主要起储存已基本无害化的粪液作用。
生物化粪池通过利用微生物的降解作用来处理污水。在化粪池内，微生物会附着在填料或者池壁上，形成生物膜。当污水流过时，微生物会吸附并分解污水中的有机物，将其转化为无害的物质，如二氧化碳和水。这个过程既能够减少污水中的有害物质，又能达到净化水质的效果。
