冷藏集装箱的陆上运输工具中有温控集装箱的水运交通工具，以及运用更高运速的空中运输工具。但是用户在选择以上三种运输方式的时候，还应该仔细去考虑冷藏运输多少钱这个问题，因为只有在不断的对比和分析当中，才能选择出适合自身的冷藏运输方式。
冷藏集装箱超期箱的清理及措施：超期箱的存在将增加船公司的经营成本，降低资源有效利用率。因此船公司加强超期箱的管理，定期清理超期箱。船公司通常都有自己的集装箱跟踪系统，通过该系统可以查出目前本公司所有集装箱的动态，从而可以查出超过期限的超期箱的详细情况。通常船公司须每周清理一次超期箱，根据集装箱跟踪系统编制的超期箱清单逐一核查集装箱超期的原因，然后同有关方联系敦促其将超期箱尽快出运。
机械式冷藏集装箱也有一些缺点：如设备复杂、初始投资大、维修费用高；箱内温度梯度要大于液氮冷藏集装箱；箱内需设风机、风道系统，会增加箱内货物的干耗、脱水。
冷藏集装箱可用于多种交通运输工具进行联运
可以从产地到销售点，实现“国到国”直达运输，
一定条件下，可以当作活动式冷库使用
冷藏集装箱的使用要求：
冷藏箱装货后应检查冷藏或冷冻货的原有质量，并在货单上加以说明。
在装箱过程中，应严格装货堆码原则，避免冷风短路造成降温不平衡，降冷装置的制冷效率。
冷藏集装箱的水果的低设定温度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷冻货物通常被认为是“惰性(inert)”货物，一般在-18℃（0°F）或更低温度下运载。既然冷藏和冷冻货物都是易腐烂的，就注意确保这类货物以佳状态交付。对于冷藏货物，除了有限的几种例外情况（比如肉，巧克力，胶片，化学物品，奶制品，人工气调储藏运输货物）外，其通风设备通常要保持开启状态。
冷藏集装箱的一些货物可能要求湿度控制或者大量的新鲜空气（比如球茎花卉）。应当注意大多数冷冻装置仅能够减少湿度，并且这取决于所提供的新鲜空气的数量。人工气调储藏运输的货物需要使用能够利用氮和二氧化碳替代氧气水平的用途的集装箱，来延长已采摘的产品的保质期。这种方法适用于许多有核和无核水果，但要求具备的知识来确定适宜的气体浓度水平。
随着现代化集装箱码头在世界各地的新建和集装箱码头基础设施和设备的不断完善，门到门的冷藏集装箱运输为食品冷链运营提供广阔的发展空间。因为满载食品、水果或者果汁的冷藏集装箱可以直接从农场、果园或者加工厂开到超级市场仓库或者配送中心，而拥有自足或者电力供应系统的冷藏集装箱本身也是冷藏食品的临时仓库，在远洋货轮、火车、驳船或者卡车上远途运输，尤其是现代化集装箱船可以把大批水果冷藏箱从拉丁美洲，长途跋涉地运到远东，中东、北美和欧洲等地区。
冷藏集装箱优点：
1、冷藏集装箱装载容积利用率高，营运调度灵活，使用经济性强。
2、冷藏集装箱使用中可以整箱吊装，装卸，运输费用相对较低。新型冷藏集装箱结构和技术性能更合理，有广泛的适用性。
3、冷藏集装箱在一定条件下。可以当作活动式冷库使用，以调节市场供应，给营销者带来良好的经济效益。
4、冷藏集装箱可用于多种交通运输工具进行联运，中间无需货物换装，而且货物可不间断地保持在所要求的低温状态。
5、对国内和国际间的“冷链”运输，可以从产地到销售点，实现“国到国”直达运输，为各类食品的新鲜度，提供了佳贮运条件。
