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荔枝根系因苗木繁殖方法不同而异。实生树及嫁接树有发达的主根;高压(圈枝)繁殖的荔枝侧根须根发达,没有主根。荔枝的根系由很多粗壮发达的侧根和纤细茂密的细根所组成,初生的幼根白色,肉质,质脆易断,俗称“豆芽根”。
荔枝树树体高大,百多年生的树高16.0米以上,树冠直径15.0米以上,主干粗大。树皮粗糙成微龟裂状,但较龙眼光滑,灰白色、灰褐色或黑褐色。
土层瘠薄或地下水位高,树冠较小;土层深厚肥沃,树冠较大。驳枝繁殖的植株主干不明显,且多为3~4条主干,成多干型,树冠较开张,成半圆头形;实生植株,主干明显,成单干型,树冠多成圆头形。
荔枝枝梢的特性因品种而异。禾荔的枝条密而短;大造、水东疏而长;桂味硬而脆。荔枝新梢黄绿色,表皮着生许多灰白色的圆形或椭圆形的斑点;老熟的枝梢灰褐色;多年生枝条颜色较深。
荔枝为聚伞花序,圆锥状排列。花穗由主穗、侧穗、支穗及花组构成。主穗基部(龙头桠)及叶腋处还抽生若干腋侧穗。
荔枝花穗抽出至开花前的孕蕾期长短与多种因素有关,但以冬春(1~3月)的气温影响大,一般为30~40天,而开花期的长短则与品种、气候、花穗抽生早迟等有关,短的仅15天,长的可达86天,荔枝树的开花有如下特性。