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蓝莓苗的根系没有根毛。正因如此，蓝莓根系的吸收能力比具有根毛的根系小得多。其吸收面积只有同样大小具有根毛的小麦根系的1/10。蓝莓的根系细，呈纤维状，细根在分枝前直径为50～75um。
值得注意的是，几乎所有蓝莓的细根都有内生菌根的寄生，从而克服蓝莓根系由于没 有根毛造成的对水分及养分的吸收困难。近年来，众多的研究已，菌根的寄生对蓝莓生长是有益的。
矮丛蓝莓根系的主要部分是根状茎。据估计，矮丛蓝莓大约85%的茎组织为根状茎。不定芽在根状茎上萌发，并形成枝条。根状茎一般为单轴形式，直径3～6。根状茎分枝频繁，在地表下6～25深的土层内形成紧密(穿插)的网状结构。新发生的根状茎一般为粉红色，而老根状茎为暗棕色并且木栓化。矮丛蓝莓的根系分布在上层中的有机质层。

蓝莓苗温度要求：小拱棚内温度适宜范围为15-30℃，白天比较适范围22-25℃，夜间17-20℃。低于13℃或32℃不利于生根。温度过高时，要及时降温，可采取遮荫或喷水降温方式。在根群形成前，植株新叶未萌生。尽量不采取揭膜放风降温，以免植株受到伤害。移苗前5-7 d揭去薄膜，适当炼苗，温度10℃即可，提高移栽成活率。

蓝莓苗湿度要求：蓝莓生根驯化阶段空气相对湿度适宜范围为60%～90%。当湿度降低时，采取微喷方式增加湿度。不同时期对湿度的要求不同，初期(定植后一新根初始形成)保持高湿状态，不低于75%，确保植株不失水，利于生根。

蓝莓苗繁殖，秋季种植有利于蓝莓幼苗根系的恢复性生长，第二年春季生长快，下一年可以投产。春季种植的幼苗要经过一定的缓苗期。栽种蓝莓苗的好时节是在阳历的9-11月，这个时候的蓝莓苗已经封顶而且不会抽新梢了，已经基本上进入了休眠的状态。这个时候移栽后，在封冻之前蓝莓苗正好在萌发新的根须，对于第二年的生长有利。

用脱盆的方法移栽蓝莓苗木可以使栽苗过程变得简单，而且定植成活率和苗木生长速度都有较大的提高。苗木定植后在行内需立即用锯屑、松针、干草等覆盖，覆盖的厚度需在10厘米以上，宽度50厘米以上。如果实在没有有机覆盖物，也可以用塑料地膜覆盖，地膜以银灰色不适光的为佳，黑色次之，五色透明的较差。覆盖不仅有利于保墒田地里土壤的湿度，而且对防止草害亦有成效(透明地膜除外)。如有灌溉设备，此时可以按需要进行灌溉。在定植后2个月内应避免施肥，2个月后也只能在根系达到的范围之外追施少量的肥料。在定植的年要特别注意根际松土和除草。

蓝莓苗的根系适宜疏松、有机质含量高的酸性基质，一般pH值4.0～5.2为宜。不同的品种、苗龄、生育期对基质要求差异较大。小苗期对基质要求严格，随着苗龄的增长，对基质的要求可适当放宽。