花单性异株，排成顶生聚伞状园锥花序，浆果状核果，近园球形，有核4-5粒，种子卵状长园形，表面网状皱纹。花期4-5月，果8-10月成熟。
该物种分布范围属中亚热带气候，年均温6-17℃，1月均温3.1-5.1℃，7月均温15-27℃，年均降雨量1142.9毫米，无霜期287天，雾日较多，湿度较大。
在模式标本产地贵定云雾山进行实地调查表明，在6平方公里范围内仅发现5株，且属人工野外采集种植，其高度达15米，胸径17.5厘米，5株蓄积0.3387立方米，依此推算，辛氏黄檗仅存数量约345株，蓄积116.9立方米。
