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老根呈灰褐色。荔枝根系与真菌共生，形成菌根，为总状分枝式。不同品种，树表皮的色泽和糙度有差异。水东黑叶、大造等品种的树干灰白色，表皮较光滑，黑叶、糯米糍、禾荔等品种，树干黑褐色，表皮较粗糙。
荔枝树树体高大，百多年生的树高16.0米以上，树冠直径15.0米以上，主干粗大。树皮粗糙成微龟裂状，但较龙眼光滑，灰白色、灰褐色或黑褐色。
土层瘠薄或地下水位高，树冠较小；土层深厚肥沃，树冠较大。驳枝繁殖的植株主干不明显，且多为3～4条主干，成多干型，树冠较开张，成半圆头形；实生植株，主干明显，成单干型，树冠多成圆头形。
由叶芽抽出带叶的枝条称营养枝。一般长度为20～30厘米，徒长枝长达60～100厘米。末次梢营养充足生长良好，次年能抽穗开花者，称为结果母枝。
荔枝花型有雌花、雄花、两性花和变态花四种。雌花、雄花数量多，生产上作用大，两性花数量较少，变态花授粉不良，故在生产上作用不大。
荔枝花穗抽出至开花前的孕蕾期长短与多种因素有关，但以冬春（1～3月）的气温影响大，一般为30～40天，而开花期的长短则与品种、气候、花穗抽生早迟等有关，短的仅15天，长的可达86天，荔枝树的开花有如下特性。
