可以说复合碘是一种比较好的杀菌剂，具有杀菌速度快、杀菌广谱、水体环境适用度宽等特点。所以，复合碘在虾蟹养殖中是除了生石灰、二氧化氯、漂白粉、聚维酮碘之外的另外一个具有很好杀菌效果的碘制剂杀菌剂。
由于复合碘对于原生动物的蛋白质都有阻碍合成的作用，所以使用后池塘中的有益菌会和其他真菌、病毒一样都会被杀灭掉。所以，在使用了复合碘之后还是需要对池塘进行重新培菌
复合碘是很好的浸泡消毒药[消毒药，中药名。]品，主要是作为消毒剂使用，复合碘可以浸泡鱼卵，给器具消毒，很多时候都可以使用复合碘，因为复合碘中含有的碘元素活性很强，对细菌、病毒、霉菌、原生动物、芽孢、孢子虫、线虫均有抑制和杀灭的作用。
复合碘还可以使用在无鳞鱼[无鳞鱼是指天生无鳞和鱼鳞很小的鱼种，并不是单指一点鱼鳞都没有的鱼。]身上，由于无鳞鱼对许多消毒药具有很强的敏感性，比如江团、斑点叉尾鮰等，因此要使用比较温和的药物。
复合碘和分析纯碘有什么区别
复合碘和纯碘区别在于二者不是一类物质，用途作用都不相同。根据查询相关资料区别如下：
刺激性不同。由于复合碘伏中含有酒精，刺激性相对于碘伏比较强，尤其是在消毒伤口或者是黏膜时，刺激性会比较大。而碘伏由于不含酒精，在擦拭涂抹伤口时一般不会刺激伤口。复合碘伏和碘伏，除了可以用于皮肤消毒以外，在做手术之前也可以对手术部位进行消毒，以及手术器械消毒等。
复合碘溶液的制备使用什么表面活性剂
复合碘溶液的制备使用什么表面活性剂
表面活性剂(surfactant)，是指加入少量能使其溶液体系的界面状态发生明显变化的物质。
表面活性剂作用：表面活性剂的分子结构具有两亲性：一端为亲水基团，另一端为疏水基团；亲水基团常为极性基团，如羧酸、磺酸、硫酸、氨基或胺基及其盐，羟基、酰胺基、醚键等也可作为极性亲水基团；而疏水基团常为非极性烃链，如8个碳原子以上烃链。
