玻璃钢防腐衬里的结构设计主要有两种形式，一种是复合结构，一种是单一结构，在玻璃钢防腐衬里结构设计中，也可采用采用布和毡交替衬里，这样，可提高衬里质量，减少气泡、夹层等缺陷。
玻璃钢防腐衬里用几层布，主要按介质条件决定。有的采用玻璃钢作衬里层，面层涂氯磺化聚乙烯面漆数道，可提高衬里层的耐蚀性能，同时与底层粘结良好。
玻璃钢作衬里层防腐，面层涂玻璃鳞片衬里，可提高衬里层的抗渗性能，同时二者的粘结性能良好。还有采用底层衬环氧玻璃钢，环氧呋喃玻璃钢作过渡层，面层涂衬呋喃玻璃钢，既解决了层间的结合，又解决了耐酸碱交替的介质腐蚀问题。
