阳、阴树脂都有被污染的问题，但是这两种树脂铁污染的机理却不相同。除盐设备中阳树脂接触的是原水中和铁离子、铁凝聚过的产物和腐蚀产物。水中的铁离子被阳树脂吸收后，较难再生出来，腐蚀产物在再生时反而变为铁离子，在较低的再生剂量下，还会被出水端树脂吸收。铁离子污染，会使颜色变深、加速氧化降解、性能逐渐降低、出水水质恶化水量减少；阴树脂受铁污染情况则不同，往往是由再生液带入的铁沉积在阴树脂上，并和硅、有机物等结合在一起成为一种复杂的物质形态使阴树脂受污染，而且这种污染是累积式的。
树脂在水处理中的应用：
1.可用于水质软化和脱盐、制取软化水、纯水和超纯水。
2.在废水处理中,可除去废水中的某些有害物质，回收有价值化学品、重金属和稀有元素。
3.在化工、生物制药等方面，能有效地进行分离、浓缩、提纯等。
4.在食品行业中可以用于制糖、味精、酒的精制。
5.饮用水的过滤，去除钙镁离子，降低饮用水的硬度。
6.在有机合成中，离子交换树脂可以作为催化剂，进行酯化、水解等反应。
7.湿法冶金及其他离子交换树脂可以从贫铀矿里分离、浓缩、提纯铀及提取稀土元素和贵金属。
随着时间的推移，污染物离子与离子交换树脂中的所有可用交换位点结合。一旦树脂耗尽，通过所谓的再生循环将其恢复以供进一步使用。在再生循环期间，通过施加浓缩的再生溶液基本上逆转离子交换反应。根据树脂的类型和手头的应用，再生剂可以是盐，酸或苛性碱溶液。随着再生循环的进行，离子交换树脂释放污染物离子，将它们交换为再生溶液中存在的离子。污染物离子将作为再生剂流出物流的一部分离开树脂系统，并且需要被适当地排出。
