通常，冷藏货物可以分成两种：冷藏和冷冻
许多冷藏货物（例如水果）被视为是“活性（live）”货物，因为其在采摘过后仍然能够进行呼吸并且由于自热、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他条件而容易腐烂。然而，其它商品比如冷藏肉/鱼类和奶酪则并非如此。水果的低设定温度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷冻货物通常被认为是“惰性(inert)”货物，一般在-18℃（0°F）或更低温度下运载。既然冷藏和冷冻货物都是易腐烂的，就注意确保这类货物以佳状态交付。对于冷藏货物，除了有限的几种例外情况（比如肉，巧克力，胶片，化学物品，奶制品，人工气调储藏运输货物）外，其通风设备通常要保持开启状态。一些货物可能要求湿度控制或者大量的新鲜空气（比如球茎花卉）。应当注意大多数冷冻装置仅能够减少湿度，并且这取决于所提供的新鲜空气的数量。人工气调储藏运输的货物需要使用能够利用氮和二氧化碳替代氧气水平的用途的集装箱，来延长已采摘的产品的保质期。这种方法适用于许多有核和无核水果，但要求具备的知识来确定适宜的气体浓度水平。
冷藏集装箱的货物检查，在装箱之前应对冷藏水果和蔬菜的温度以及冷冻货物的中心温度进行检测。还应检查水果和蔬菜是否存在比如发霉、枯萎、脱水、萎蔫、褪色、软点、破皮和脱皮、擦伤、冻伤和发臭等冷藏前的损坏。对于冷冻货物还应检查其是否有脱水、干燥、移位、发臭、黑斑和颜色改变，以及是否有因温度升高解冻后又重新冷冻的迹象。还应检查纸箱、托盘和其他包装物状况是否良好，是否能够在整个海运过程中保护货物状况。
冷藏集装箱装箱前准备工作：根据不同易腐货物应确认下述事项：理想温度设定;新鲜空气换气量设定;相对湿度设定;运输总时间;货物体积;采用的包装材料和包装尺寸;所需的文件和单证等。
装箱前及装货时应注意：设定的温度应正确;设定的新鲜空气换气量应正确;设定的相对湿度应正确;装箱时制冷系统应停止工作;箱内堆装的货物应低于红色装载线和不超出T型槽的垂直面;箱内堆装的货物应牢固、稳妥;箱内堆装货物的总重量应不超过冷箱允许载重量;冷藏集装箱装货后总重量(包括附属设备的重量)在运输途中不应超过任一途经国的限重。
冷藏集装箱装货注意事项
(1)冷冻集装箱在装货过程中，在检查冷冻装置，确认冷冻机已停止运转;
(2)货物预冷：在装货前，要对冷冻集装箱内使用的垫木和其他衬垫材料要预冷，并要对货物应进行预冷处理，并预冷到运输要求的温度，因冷箱设计制冷能力有限，仅能用于保持货物的温度。如果货物温度过高，将使制冷系统超负荷工作，导致该系统出现故障，影响货物运输。
冷藏集装箱根据制冷方式分类
(1)外置式冷藏集装箱。无制冷装置，箱体隔热结构良好，箱端处有软管连接器，可与船上或陆上冷冻站的制冷装置连接，供给箱体冷源。
(2)内藏式冷藏集装箱。箱体设有制冷装置，由船上或陆上电源供电，或自备发电机供制冷装置运行使用，以向集装箱供冷。
(3)冷冻板冷藏集装箱。利用冷冻板低温共晶溶液进行蓄冷并向集装箱提供冷源。
(4)液氮或干冰冷藏集装箱。利用液氮喷淋或干冰向集装箱提供冷源。
(5)气调冷藏集装箱。利用控制集装箱内空气中的氧、二氧化碳和乙烯等气体的浓度，抑制果蔬的呼吸和催熟作用，并把向内温度降至所需贮藏温度的一种特种冷藏集装箱。
冷藏集装箱出租是指集装箱增加了冷藏功能后对外出租的一种方式，早期很多食品两地运输的距离过长，路上花的时间过久导致变质损坏，慢慢的人们在集装箱里面增加了冷藏功能，这是冷藏集装箱的来源。现在陆运或者海运冷藏集装箱的使用率都很高，已经变成了一种通用的运送工具。
