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木瓜蛋白酶（Papain），又称木瓜酶，是一种蛋白水解酶。木瓜蛋白酶是番木瓜（Carieapapaya）中含有的一种低特异性蛋白水解酶，广泛地存在于番木瓜的根、茎、叶和果实内，其中在未成熟的乳汁中含量丰富。木瓜蛋白酶的活性中心含半胱氨酸，属于巯基蛋白酶，它具有酶活高、热稳定性好、天然卫生安全等特点，因此在食品、医药、饲料、日化、皮革及纺织等行业得到广泛应用。
木瓜蛋白酶（papain），又称木瓜酶，是Balls等在1937年从番木瓜的未成熟果实中提取的乳液，经凝固、干燥得到的粗制品，是未经纯化的多酶体系。纯木瓜蛋白酶是由212个氨基酸组成的单链蛋白质，制品含有木瓜蛋白酶、木瓜凝乳蛋白酶、木瓜凝乳蛋白酶M（chymopapain M）和溶菌酶等。
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