潜藏指纹往往是手指先接触到油脂，汗液或尘埃后，再接触到乾净的表面而留下，虽然肉眼无法看到这类指纹，但是经过特别的方法及使用一些特别的化学试剂加以处理，即能显现出这类潜藏的指纹。
如果指纹留在纸张、卡片、皮革、木头等吸水性物品的表面，经过化学处理才能在化验室显形。常用的化学法有:
碘熏法——即使用碘晶体加温产生蒸气，它与指纹残留物的油脂产生反应后，便会出现黄棕色的指纹，立即拍照或用化学方法固定。
宁海得林(Ninhydrin)法——将试剂喷在检体上，与身体分泌物的氨基酸产生反应后，会呈现出紫色的指纹。
硝酸银法——硝酸银溶液与潜伏指纹中的氨化钠产生反应后，在阳光下会产生黑色的指纹。
萤光试剂法——萤光氨与邻苯二醛几乎马上与指纹残留物的蛋白质或氨基酸作用，产生高萤光性指纹，此试剂可以用在彩色物品的表面。
采集证据还可以使用其他的方法：
1、三秒胶法，即利用氰丙烯酸酯的气体与水和氨基酸分子反应而产生指纹。
2、适用于玻璃杯，窗框以及电灯开关灯光滑表面。，用细软的绒毛刷子轻轻拂去表面的灰尘。这些灰尘本来被汗粘在指印纹路中，去掉后，把干净的透明胶带按在指纹上，拿起后按在一张卡片上，注明时间，地点即可。
3、对粗糙表面上的指纹，比如车内饰物之类的，可用氰基丙烯酸盐粘合剂放在车内加热，并把车密封，这样会产生蒸气，是指纹变成白色，并固定在原地。在用方法1取下指纹。
4、对于纸上的指纹，用喷雾剂在纸上喷射茚三酮，用熨斗加热即可。
5、对于室内找不到指纹时，关掉房内所有的灯，用激光探测装置扫射房间，可以让指纹上某些化合物发光，把指纹拍摄下来就行了。
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