对经济特区内生产企业申请自荐进出口经营权试行自动登记制，经济特区的生产企业，注册资本200万元以上，并已投入生产，均可向当地外经贸主管部门申请登记，外经贸主管部门应在15个工作日内对符合条件的生产企业予以登记，即取得出口自产产品和进口生产所需的机械设备、原辅材料的进出口经营权，可按规定到海关、商检、外汇、工商、税务等管理部门办理有关手续。生产企业在申请自营进出口权的过程中，对外经贸主管部门的决定不服，可根据《行政复议条例》向外经贸部申请复议。
各经济特区外经贸主管部门按照外经贸部规定的必要条件和标准，自行审批在经济特区内从事进出口业务的外贸企业，并报外经贸部备案。外经贸部已核准五个经济特区1996年的总量为2013家。
只要是具有较强的技术及技术产品研究开发能力，并在科技成果商品化、产业化方面取得实绩，申请进出口权前两年，委托代理出口平均创汇额不低于30万美元的科研院所，经国家科委推荐，外经贸部即受理其进出口经营权的审核、批复工作。
私营生产企业或科研院所向注册所在地外经贸主管部门提出书面申请，经省、自治区、直辖市及计划单列市外经贸主管部门审查后报对外贸易经济合作部（以下简称外经贸部）审批。
变更企业名称须经工商行政管理机关办理名称预先核准，报外经贸部办理相应批准手续；注销的须报外经贸部备案。
可以申请加入进出口商会、参加国家和地方外经贸主管部门组织的有关对外经济贸易活动，并得到国家对外贸易方针和政策的指导。
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