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虽然二氧化碳有潜在毒性，但是除非我们生活在潜艇或者外太空中，否则房屋内二氧化碳浓度高到中毒的可能性不是很大。
更多情况下，室内二氧化碳浓度过高会造成一些隐秘却持久的危害，并且这种危害会因为每个人的不同体质而有所不同。以下是部分二氧化碳含量过高所造成的危害：
心理表现更糟糕
有研究将四组人放在二氧化碳水平不同的房间里，然后对其进行标准化的认知测试。组房间浓度分别为600ppm和2500ppm，第二组为500ppm和1400ppm。结果显示，两组中留在二氧化碳浓度相对高的实验对象，认知水平都相对更低。这种心理表现的差异具体体现在决策、使用信息和应对危机上。
头痛
宇航员在二氧化碳浓度很高的空间站中经常会出现头痛的症状，也更容易烦躁。因为这一点，二氧化碳浓度问题得到了更加广泛的关注。
嗜睡
嗜睡是通风不良的环境——比如拥挤的教室或者沉闷的办公室——中常见的现象。有一项实验是将实验对象放在通风不良和通风顺畅的房间里进行了四小时的测试，结果发现在通风差的房间中（室内二氧化碳含量为2800ppm），人体的二氧化碳数值也更高，实验对象也反馈称更容易打瞌睡。但是通风不畅的环境下容易嗜睡，是否仅仅是因为二氧化碳浓度，这一点在科学界还存有争议。
