臭氧能氧化分解细菌、病毒内部氧化葡萄糖所的葡萄糖氧化酶，并直接与细菌、病毒发生作用，氧化并穿透其细胞壁，破坏其细胞器和核糖核酸，分解DNA、RNA、蛋白质、脂质类和多糖等大分子聚合物，使细菌、病毒的新陈代谢和繁殖过程遭到破坏，而夺取细菌病毒的生命。同时还可以渗透细胞膜组织、侵入细胞膜内作用于外膜脂蛋白和内部的脂多糖，使细胞发生通透性畸变，导致细胞溶解性死亡，并将死亡菌体内的遗传基因、寄生菌种、寄生病毒粒子、噬菌体、支原体及热源（内毒素）等溶解死亡。综观无菌技术对微生物作用的原理可分为型、杀菌和溶菌型三种。臭氧灭菌消毒属于溶菌型剂体，可以达到“、地消灭物体内部所有微生物的目的”，不仅这样而且它的作用是瞬间完成的。
臭氧的应用主要以发生量来确定，分为气态下消毒和液态下消毒两大类。臭氧发生量和使用量一般按照发生量的额定发生量乘以时间来确定，但在不同的用途和不同的场所应计出衰减量而后确定。臭氧发生器在使用中，气源的配置直接影响臭氧的发生浓度、产量和纯度，气源一般分为普通气源、干燥空气源、富氧气源和工业氧气气源四种，以上气源的配置 ，在发生装置相同的情况，浓度和产量依次递增。按照应用常识，一般不应配置普通气源，因为这会影响发生装置的连接使用寿命并导致发生量不稳定。
臭氧与消毒剂比较： 臭氧作为广谱无残余污染的气体消毒剂比食品行业常用的消毒剂（如过氧乙酸、高锰酸钾、甲醛、二氧化硫）等具有特殊的性臭氧会自行分解为氧气，不产生残余污染，消毒后不需通风换气。常规消毒均需通风换气或化学中和，麻烦而又降低消毒效果。
臭氧机除臭是通过臭氧发生器产生臭氧，臭氧机氧化臭气体如：氨、胺、硫化氢、甲硫氢、甲硫醇、甲硫醚、二甲二硫、二硫化碳和苯乙烯，硫化物H2S、VOC类，苯、甲苯、二甲苯等，使呈游离状态的污染物分子与臭氧氧化结合成小分子无害或低害的化合物，如CO2、H2O等，从而达到除臭的效果。臭氧除臭过程中，成本低，几乎不需要添加药剂;除臭速度快，通常几分钟就能达到除臭效果;如果臭氧设备保养的好，使用周期较长，更换频率很低。药剂除臭，有一定的局限性，不如设备除臭。而UV紫外灯除臭过程中，臭氧浓度过低，除臭效果有限。综合来看，臭氧机经济实惠。
臭氧主要存在于距地球表面20千米的同温层下部的臭氧层中，含量约50ppm。它吸收对人体有害的短波紫外线，防止其到达地球，以屏蔽地球表面生物，不受紫外线侵害。
臭氧机生产的臭氧的氧化能力，其氧化还原电位仅次于氟，在其应用中主要用这一特性。
臭氧支持燃烧，可燃物放入臭氧中可发生自燃现象且燃烧较氧气中更加剧烈。
臭氧与亚铁、Mn2+ 、硫化物、硫氰化物、氰化物、氯等均发生反应，臭氧在水溶液中与有机物的反应极其复杂。
⑴ 臭氧与烯烃类化合物的反应 臭氧容易与具有双键的烯烃化合物发生反应，反应的终产物可能是单体的、聚合的、或交错的臭氧化物的混合体。臭氧化物分解成醛和酸。
⑵ 臭氧和芳香族化合物的反应 臭氧和芳香族化合物的反应较慢，在系列苯<萘<菲<嵌二萘<蒽中，其反应速度常数逐渐增大。
⑶臭氧机的臭氧对核蛋白(氨基酸)系、有机氨也都发生反应。
因下水道不能一直保持关闭，里面的秽气就会随着地漏口进入卫生间，虽然 我们都会将卫生间清洁的很好，有时还会有一些难闻的味道，这就是细菌在作怪。它们可以把下水道中的菜叶、饭渣分解，从而产生秽气，其中包含硫化氢，有臭鸡蛋气味，甲醛等。这时候，我们就可以准备一盆自来水，将臭氧机的导气管通入自来水中，制成臭氧水，倒进下水道中。因臭氧水有很强的杀菌消毒的作用，这些细菌就思密达了。
长时间使用，也会很难闻，及时用肥皂，洗衣液清洗，但是晒干之后，发现 味道还有，这就很讨厌了。那是因为毛巾上面滋生了细菌，分解毛巾上面的附着物，产生的怪味。同样，我们可以讲毛巾和浴巾放在臭氧水中浸泡20分钟左右，就可以烟消云散了。
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