由于专项审计调查是对经济领域中带全局性、普遍性、倾向性的特定事项进行系统调查了解，通过综合分析，向有关部门反映情况、揭露问题、提出解决问题的建议，为党委、决策提供依据，为国家宏观调控服务。因此专项审计调查的目标具有宏观性。
专项审计调查范围的广泛性主要体现在调查对象的广泛性和资料来源的广泛性两个方面。从对象上看，凡是与被调查事项有关的单位和个人都属于专项审计调查的范围。从资料来源上看，专项审计调查的证实材料既可以是从被调查单位的账册、报表中所收集的会计、统计数据，也可以是用调查走访有关人员等方式所收集的与被调查事项有关的其他资料。
专项审计调查的目的是为上级经济决策提供依据，因此作出审计调查结论和提出审计调查建议要在上级有关部门作出决策之前，否则就会错过时机，使审计调查失去了应有的价值。
专项审计调查报告是专项审计调查工作结束后，专项审计调查组向审计机关提出的报告。专项审计调查报告是反映问题、分析原因和提出意见建议的载体，是反映调查成果大小的关键。
专项审计调查，应成立专项审计调查组，制定好审计调查方案。按照审计计划，审计机关应根据专项审计调查事项的大小和工作难易程度及要求，指派能足够胜任该项工作的人员，组成调查组，确定调查组组长，实行组长负责制，明确责权。并由调查组组长负责拟定专项审计调查方案报请审计机关批准。在具体实施过程中，依据实际情况的发展变化，需要对专项审计调查方案进行调整，亦应在调整时补办报批程序和手续。专项审计调查方案涉及的主要内容包括调查的目标、范围、内容、程序、时间和人员分工等。
实施专项审计调查与实施项目审计的方法和要求是基本相同的。实施专项审计调查的过程中，主要采取审计的方法取得被调查单位的有关材料，与项目审计一样，取得的证明材料应当客观、相关、充分和合法，足以证明被调查事项。取得的有关重要事项的证明材料，应当由提供者签名或者盖章予以核实和确认。不能取得提供者签名或者盖章的，审计调查人员应当注明原因。审计调查人员向被调查单位之外的有关单位和个人调查时，应当履行出示审计人员的工作证件和专项审计调查通知书副本的手续和程序。
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