吸粪车收集的粪便需要进行固液分离，所得液体进入城市污水处理厂进行处理。剩余的固体粪便残渣将被脱水，然后送往垃圾填埋场进行卫生填埋。填埋成本低，易于操作，但受填埋场的限制。
除了卫生填埋外，从化粪池中提取的粪便还可以在脱水后用于堆肥，类似于普通人用粪便制备农场粪便的方式。堆肥生产的有机肥料主要用于绿化或采矿等地区的土壤改良。
技术加工
除了自然处理外，一些城市还使用技术处理方法来处理收集的粪便。常见方法包括：
1.生物发酵处理：粪便可以添加到酵母、霉菌等微生物中发酵，终将未消化的粪便转化为有机肥料。
2.厌氧处理：这种处理方法利用高科技设备通过厌氧菌的作用处理粪便，减少粪便造成的污染。例如，拉丁美洲国家的许多吸粪车都采用了这种处理方法。
吸粪车收集的粪便通常被运往农村地区用作有机肥料。这些肥料广泛用于蔬菜种植，为土壤提供养分。
2.粪便也可以发酵产生沼气，沼气可以用作气体，沼渣也可以用作肥料。然而，这种方法成本高昂，因此只有少数部门或单位会采用这种方法。对于个人来说，没有强制要求这样做。
3.日常生活中产生的粪便通过冲洗系统排入化粪池。相关单位将定期使用吸污车清理各种化粪池中的污水。清理后的废物将被运往偏远地区倾倒，倾倒通常在无人注意的地方进行。
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