然而，强磁打捞器在使用过程中也可能会遇到一些问题，例如，强磁打捞器在内压不高的情况下出现内置钢板鼓起，这可能是由于生产厂家在设计时未充分考虑抗内压强度问题，导致内置钢板的抗内压强度低。这种情况下，磁条可能会崩掉落井，从而导致打捞失败。
磁铁具有指向性，当其悬挂起来静止时，一端会指向地球南极（称为指南极或S极），另一端指向地球北极（称为指北极或N极）。磁铁间的相互作用表现为同名磁极相排斥、异名磁极相吸引。
为了避免腐蚀损害，钕铁硼磁铁在使用时需要在其表面做保护处理，例如通过电镀金、镍、锌、锡或者喷涂环氧树脂等方法。近年来，随着技术的进步，还出现了如纳米螯合薄膜无镀层处理等新型表面处理技术，以提升其耐腐蚀性和其他物理性能，从而满足更多应用领域的需求