大孔吸附树脂是否失效，主要以所吸附物质来确定。如果判断单周期运行终点，则可以根据所吸附底物性质来定，具体可以通过测定PH、电导率、折光、色谱等方法测定。一旦出口有少量底物泄露，说明部分树脂已经失效，此时可根据实验目的判断是否继续运行，若出口几乎已经与入口一致，则树脂基本上已经完全失效。
在现有的吸附树脂中，大多数为非极性或弱极性。如果在储存过程中失去了其内部水份，其使用性能将大打折扣。判断吸附树脂是否失水，主要看其是否大量漂浮在水面上。如果树脂失去了部份或全部水份，则要用极性有机溶剂如甲醇、乙醇或丙酮等浸泡数小时。然后将极性溶剂用水洗去，树脂即可使用。
根据极性“相似相溶”的原理，对非极性大孔吸附树脂来说，洗脱剂极性越小，其洗脱能力越强，而对于中极性大孔吸附树脂和极性较大化合物，则用极性较大的溶剂较为合适，此外，上柱液浓度、pH值及外界温度也是影响其吸附性能的重要因素。
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