为了解决集装箱进出口不平衡的问题，船公司通常要向出口大于进口的地区调拨大量空箱。由于空箱的调拨要增加大量调拨成本，船公司在空箱调拨进口至空箱装货出口的过程中更应加强集装箱管理，避免超期箱的出现。在集装箱运输中空箱由进口到出口的整个流程可以归结如下：
冷藏集装箱船舶进港→空箱卸船→码头堆存→集装箱车队拖箱→空箱进堆场→发货人提箱→装箱→重箱进港区→装船。
冷藏集装箱可用于多种交通运输工具进行联运
可以从产地到销售点，实现“国到国”直达运输，
一定条件下，可以当作活动式冷库使用
随着现代化集装箱码头在世界各地的新建和集装箱码头基础设施和设备的不断完善，门到门的冷藏集装箱运输为食品冷链运营提供广阔的发展空间。因为满载食品、水果或者果汁的冷藏集装箱可以直接从农场、果园或者加工厂开到超级市场仓库或者配送中心，而拥有自足或者电力供应系统的冷藏集装箱本身也是冷藏食品的临时仓库，在远洋货轮、火车、驳船或者卡车上远途运输，尤其是现代化集装箱船可以把大批水果冷藏箱从拉丁美洲，长途跋涉地运到远东，中东、北美和欧洲等地区。
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