现在，化石该词专指史前生存但被自然埋藏和保存的的残体。多年之迷希腊哲学家认为化石是十分奇怪的自然现象，就像水晶和钟石一样是在地下形成的。马丁·路德(1483/u1546)相信在山峰上发现的化石是《圣经》之血的证据。列奥纳多·达·芬奇(1452～1519)在他的笔记中写到：化石是曾经生存过得体的石化残体。他的观点在那个时代被认为是异端邪说，直到19世纪，他的笔记才被公开。
通常那些外形似化石却不具有化石内部结构和构造的无机产物，比如地层中的矿质结核、硬锰矿的树枝状沉淀（树枝石）等不能视为化石，这些无机结构称为假化石。另外，化石是保存在地史时期形成的岩层中，而埋藏在现代沉积物中的生物遗体，或者人类有史以来的考古文物都不属于化石。
各门类古生物化石的具体鉴定方法不尽相同，但一般都要经过下述步骤：
①熟悉标本外部形态和内部构造，对大化石的细微构造或微体化石，一般需要借助实体镜、显微镜或电子显微镜进行观察。有时要将化石做连续切片,以便于了解其内部构造特征;
②利用所具有的知识并查阅有关文献,确定较大的分类阶元,一般定到科；
③利用检索表、图版等文献资料， 将标本进一步检索到属、种；
④选择有代表性的种群标本或典型的单个标本进行特征描记，度量各种性状要素及照相
鉴定化石标本时，主要借助某一类别或某一地层层位中发现的化石的有关专著，并查阅专著出版后发表的有关论文。鉴定人员在进行正确、全面的资料查阅对比后，发现所要鉴定的化石与文献中所描记的某一生物化石完全相同，就可以将该化石归在同一名称之下。如果没有发现相同的特征记述，就可以这批标本为基础，建立新种、新属等新的分类，并给予适当的名称。建立新种的标本称为模式标本，据以命名一个属的种，称为模式种(或属形种、属型)。同样，还有模式属等。
由于种以种群为单位生活，其中存在着连续的个体变异。然而模式标本往往只是某个物种发现的标本，不一定全面地反映该种的特征。在这个概念指导下，没有一个个体是种群性状的“典型”。在鉴定物种时，要尽可能多地、全面地采集标本，使得这些标本能大体反映真正种群的总面貌，然后，用各种统计方法来区分种间变异和种群内变异，从而达到鉴定物种的目的。
据1993年6月报道，全世界总共已发现大约500个恐龙蛋化石。其中，含有胚胎的恐龙蛋化石只有100个左右。随着恐龙蛋化石的不断发现，全世界已发现恐龙蛋化石的总数在不断增大。另据1993年7月报道，中国河南省的西部和西南部特别是西峡地区，大量恐龙蛋化石的新发现，刷新了世界恐龙蛋化石的陈旧统计数据。有关认为，过去中国已发现的恐龙蛋化石大约有400多个，约占世界已发现恐龙蛋化石总数的80%。仅河南省一位收藏家收藏的恐龙蛋化石就达2000多个。据初步统计，中国已发现的恐龙蛋化石约有4000个左右。其总数居世界。恐龙蛋化石市场价格在50到80万一个，拍卖价格更高。
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