高新技术企业认定部门一般是科技部、财政部、税务总局负责全国高新技术企业认定工作的指导、管理和监督。各省、自治区、直辖市、计划单列市科技行政管理部门同本级财政、税务部门组成本地区高新技术企业认定管理机构。认定机构下设办公室，由省级、计划单列市科技、财政、税务部门相关人员组成，办公室设在省级、计划单列市科技行政主管部门。
进行高企认证的企业的创新主要是自主创新，其特点为自主技术创新不可能在技术的每一个环节上都是创新的，但其中的核心技术或主导技术是由企业依靠自身力量立研究开发而获得的，这是“自主”的含义所在。目标具有率先性，自主创新的技术成果具有占性。知识和能力的支持是创新成功的内在基础和必要条件。自主开发技术的创新模式，主要用于全新创新或重大的突破性技术创新，它需要有很大研究与发展的投入，有较雄厚的技术力量，并有较多的技术积累。在竞争中取得地位时，采取这种模式。
高企认证企业的知识产权通过自主研发、受让、受赠、并购等方式，获得对其主要产品（服务）在技术上发挥核心支持作用的知识产权的所有权；专利有效；知识产权权属人为申请企业；多个权属人的申请高新技术企业及高新技术企业资格存续期内，只能由一个权属人在申请时使用；Ⅱ类专利只能使用一次。
一：政策倾向1，大量举办各类性。如：知识产权局讲座，科研立项管理讲座，项目申报讲座。为企业树立正确的项目申报。2，加强高新技术企业认定的审核力度。的严肃性和含金量。3，切实了解企业对项目申报的实际需求，细化、具象地推出各类优惠政策，满足不同企业的需求。4，推出培育入库项目，为企业进行高新技术企业认定提供预演练兵的机会。5，大量组建项目申报行业协会，对项目申报机构进行培训，规范管理项目申报行业。二：市场分析：1，任何行业的发展都必然经历这一过程：个别人尝试——少数人跟进——大量涌入——市场混乱——市场调整——行业规范。目前科技项目行业正进入市场混乱阶段。2，不少新成立的机构，为获取市场份额，通过发达的推广途径，大打价格战。拉低了服务费用，服务费降低的同时，必然降低服务标准。而为了达到通过率，不少服务机构没有底线地进行虚假包装。造成了质量下降，数量急剧上升的现状。3近年来，随着高新技术企业认定项目的。市面上提供高企认定服务的机构暴增。加上推广平台的助推。
固定资产折旧与长期待摊费用3.1难点 固定资产折旧与长期待摊费用摊销，是指为开展研究开发活动购置的仪器和设备以及研究开发项目在用建筑物的折旧费用，包括研究开发设施改建、改装、装修和修理过程中发生的长期待摊费用。3.2应对措施 a.检查固定资产明细账、长期待摊费用明细账；检查申报企业年度新增固定资产及长期待摊费用的、固定资产的申购单、入库单、验收单；实地查看该部分设备，核对资产用途（检查使用说明书等），确定其是否真实存在，是否用于研究开发项目。 b.结合固定资产盘点，核对与研究开发活动相关的固定资产是否账实相符；检查购入时已计入研究开发费用的固定资产，是否单管理，是否存在重复计提折旧的情况。 c.复核各项折旧、摊销的准确性及相关性，关注前后各期折旧政策及方法的一致性d.对属于多个项目使用的，检查分摊方法是否合理，且前后各期是否保持一致，分摊的金额是否正确。
认定管理办法 总 则 条 为扶持和鼓励发展，根据《共和国企业所得税法》(以下称《企业所得税法》)、《共和国企业所得税法实施条例》(以下称《实施条例》)有关规定，特制定本办法。 第二条 本办法所称的是指:在《国家支持的高新技术领域》内，持续进行研究开发与技术成果转化，形成企业核心自主知识产权，并以此为基础开展经营活动，在中国境内(不包括港、澳、台地区)注册的居民企业。 第三条 认定管理工作应遵循企体、鼓励技术创新、实施动态管理、坚持公平公正的原则。 第四条 依据本办法认定的，可依照《企业所得税法》及其《实施条例》、《共和国税收征收管理法》(以下称《税收征管法》)及《共和国税收征收管理法实施细则》(以下称《实施细则》)等有关规定，申报享受税收优惠政策。 第五条 、财政部、税务总局负责全国认定工作的、管理和监督。 第二章 组织与实施 第六条 、财政部、税务总局组成全国认定管理工作小组(以下称"小组")，其主要职责为: (一)确定全国认定管理工作方向，审议认定管理工作报告; (二)协调、解决认定管理及相关政策落实中的重大问题; (三)裁决认定管理事项中的重大争议，监督、检查各地区认定管理工作，对发现的问题整改。 第七条 小组下设办公室，由、财政部、税务总局相关人员组成，办公室设在，其主要职责为: (一)提交认定管理工作报告，研究提出政策完善建议; (二)各地区认定管理工作，组织开展对认定管理工作的监督检查，对发现的问题提出整改处理建议; (三)负责各地区认定工作的备案管理，公布认定的名单，核发证书编号; (四)建设并管理"认定管理工作网"; (五)完成小组交办的其他工作。
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