花单性异株，先花后叶，圆锥花序腋生，雄花序排列紧密，长6-7厘米，雌花序排列疏松，长15-20厘米，均被微柔毛；花小，花梗长约1毫米，被微柔毛；苞片披针形或狭披针形，内凹，长约1.5-2毫米，外面被微柔毛，边缘具睫毛；雄花：花被片2-4，披针形或线状披针形，大小不等，长1-1.5毫米，边缘具睫毛；雄蕊3-5，花丝极短，长不到0.5毫米，花药长圆形，大，长约2毫米；雌蕊缺；雌花：花被片7-9，大小不等，长0.7-1.5毫米，宽0.5-0.7毫米，外面2-4片远较狭，披针形或线状披针形，外面被柔毛，边缘具睫毛，里面5片卵形或长圆形，外面无毛，边缘具睫毛；不育雄蕊缺；子房球形，无毛，径约0.5毫米，花柱极短，柱头3，厚，肉质，红色。
核果倒卵状球形，略压扁，径约5毫米，成熟时紫红色，干后具纵向细条纹，先端细尖。
生长习性
喜光，幼时稍耐荫；喜温暖，畏严寒；耐干旱瘠薄，对土壤要求不严，微酸性、中性和微碱性的沙质、粘质土均能适应，而以在肥沃、湿润而排水良好的石灰岩山地生长好。深根性，主根发达，抗风力强；萌芽力强。生长较慢，寿命可长达300年以上。对二氧化硫、氯化氢和煤烟的抗性较强。
分布范围
在中国分布广泛，在温带、亚热带和热带地区均能正常生长。资源调查的黄连木的分布北界县市由西到东为：云南潞西、泸水-西藏察隅-四川甘孜-青海循化-甘肃天水-陕西富县-山西阳城-河北完县-北京，这一地理分布界限与中国境内1月均温-8摄氏度等温线大体一致，广泛分布于此线以南的地区。以北、以西地区较为少见。
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