数控机床和数控加工中心在加工对象、控制轴和运动方式等方面存在不同。加工中心具有加工、多轴控制、自动化加工、多功能加工和高速加工等特点，可满足不同零件的加工需求。
数控机床主要加工回转体，主要对象有圆柱、圆锥等。
数控加工中心加工多个面，加工范围更为广泛，如箱体零件、异形件、板类零件等
加工中心一般采用移动式台座，加工件固定在工作台上，在加工过程中工作台不动，而刀库、主轴等运动。因此加工中心在工作时表面较为平稳，精度要求高。而数控铣床则是工作台移动，刀具进给，因此工作面相对不太平稳，适用于校对、磨牙、连杆等简单零件的加工。
虽然加工中心和数控铣床都是数控机床的一种，但是它们在工作原理、适用范围、性能指标和结构特点上都有所不同。选择合适的加工设备需要根据具体加工要求和工件特点来综合考虑。
性能指标不同
由于其处理精度高和适用范围广，加工中心的主轴功率一般比较大，在3千瓦以上，转速达到1万转以上；而数控铣床的主轴功率较小，通常在3千瓦以下。
数控加工中心的热机特性对加工精度有重要影响，几乎占到加工精度的半数以上。加工中心的主轴、XYZ运动轴件所使用的导轨、丝杠等部件都会在运动中因负载和摩擦作用而升温变形，但热变形误差链中终影响加工精度的却是主轴和XYZ运动轴部件相对工作台的位移。
加工中心在长时间停止运行状态下和热平衡状态下的加工精度差异较大，究其原因，是因为数控加工中心的主轴和各运动轴在运行一段时间后，其温度相对维持在某一固定水平，且随着加工时间的变化，数控加工中心的热态精度趋于平稳，这就表明了加工前的主轴和运动部件预热是非常有必要的。
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