门禁及安防系统是用来保护人员和财产安全的，因此系统自身安全。这里所说的高安全性，一方面是指产品或系统的自然属性或准自然属性，应该设备、系统运行的安全和操作者的安全，例如：设备和系统本身要能防高温、低温、温热、烟雾、霉菌、雨淋，并能防辐射、防电磁干扰（电磁兼容性）、防冲击、防碰撞、防跌落等，设备和系统的运行安全还包括防火、防雷击、防爆、防触电等；另一方面，门禁及安防系统还应具有防人为破坏的功能，如：具有防破坏的保护壳体，以及具有防拆报警、防短路和开路等。
门禁控制器应该可以支持多种联网的通讯方式，如RS232、485或TCP/IP等，在不同的情况下使用各种联网的方式，以实现全国甚至于范围内的系统联网。为了门禁系统整体安全性的考虑，通讯能够以加密的方式传输，加密位数一般不少于64位。
根据系统的不同门禁系统还可以实现以下一些特殊功能：
反潜回功能：根据门禁点的位置不同，设置不同的区域标记，然后让持卡人依照预先设定好的路线进出，否则下一通道刷卡无效。本功能是让持卡人按照的区域路线进入。通常用于监狱中。
防尾随功能：是指在使用双向读卡的情况下，防止一卡多次重复使用，即一张有效卡刷卡进门后，该卡在同一门刷卡出门一次，才可以重新刷卡进门，否则将被视为非法卡拒绝进门。
双门互锁：通常用在银行金库，也叫AB门，它需要和门磁配合使用。当门磁检测到一扇门没有锁上时，另一扇门就无法正常的打开。只有当一扇门正常锁住时，另一扇门才能正常打开，这样就隔离一个安全的通道出来，使犯罪份子无法进入达到阻碍延缓犯罪行为的目的。
胁迫码开门：是指当持卡者被人劫持时，为持卡者的生命安全，持卡者输入胁迫码后门能打开，但同时向控制中心报警，控制中心接到报警信号后就能采取相应的应急措施，胁迫码通常设为4位数。
消防报警监控联动功能：在出现火警时门禁系统可以自动打开所有电子锁让里面的人随时逃生。与监控联动通常是指监控系统自动将有人刷卡时（有效/无效）录下当时的情况，同时也将门禁系统出现警报时的情况录下来。
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