全过程一般可分3个阶段：
准备阶段
主要的工作包括：①路线踏查，统一调查技术，确定土壤调查的填图单元。②收集并阅读调查区内各种有关自然、社会经济、农业和土壤的资料和图件。③准备供调查填图时用的底图，通常选用大于成图比例尺的符合精度要求的地形图(或地形-地块图);也可用航片或卫片判读方法进行。④准备调查用的装备、工具和化学分析设备等。
野外作业阶段
按统一的调查技术要求进行以下工作：①依照技术规程要求，在规定的面积范围内挖掘具有代表性的土壤剖面,进行观察、描述、记载和比较,并采集供各种用途的土壤标本。②根据土壤剖面形态特征，确定土壤变异的界线和勾绘土壤草图。③研究调查区内土壤的特性、分布与成土因素、人为因素之间的关系，以揭示土壤类型的差异及其自然分布规律。④根据成土条件和土壤特性提出土壤合理利用的途径。
室内整理资料阶段
主要的工作包括：①将野外各种资料和化学分析资料进行整理、归纳和系统化；②根据经整理的资料制订土壤分类系统和制图单元系统；③绘制土壤图和其他有关图件；④编写土壤调查报告和有关图件的说明书等。
调查资料的应用
土壤调查资料（土壤图、调查报告以及其他有关的各种图件或文字说明）可以作为全国性或区域性的综合自然区划、农业区划以及国土整治规划的依据之一,也是农业生产单位(乡、村及农、林、牧场)进行生产规划和制订改土培肥措施的重要根据。某些性的土壤调查，如荒地资源调查、工程土壤调查、低产土壤调查、侵蚀土壤调查、污染土壤调查、自然保护区土壤调查以及军事土壤调查等，其目的性和服务对象更为明确，应用性更强。
土壤资源调查是提高环境变化模拟精度的要求,人类正面临着环境变化和社会可持续发展的挑战，环境的恶化已经对人类造成的影响。采用环境模型来模拟未来环境变化已经成为预测环境变化趋势的重要方法，而详细、准确的土壤信息是些环境模型所需的基本参数。
了解土壤污染状况：随着工业化和城市化的发展，土壤污染问题日益严重。通过土壤环境调查，可以了解土壤的污染状况，包括污染物的种类、浓度、分布等，为制定相应的治理措施提供科学依据。
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