目前来看，高新技术服务费有两种主要模式 一、固定金额 即：双方就认定代办一事谈定一个固定的价格和确切的支付条件以及支付时间。使用这种支付方式的一般为老牌的正规机构。 二、比例提佣 即：企业通过认定，拿到相关补贴后。机构按照比例抽取一定的。至于比例，由双方商定。实用此类支付方式的，一般为近几年新成立的机构。因近年高企补贴大幅度提升。催生的新的机构和新的收费模式。
层要重视研发部门的设置
包括人员的配备和设备的配备。要重视研发部门与财务部门的沟通与协调。研发部门在制订研究开发项目立项报告的基础上与财务部门共同建立研发投入核算体系，建立研发人员的绩效考核奖励制度。研发部门与财务部门共同按月编制研究开发项目立项报告及企业研究开发项目情况表，以各个研发项目为单位分别进行测度并加总计算研发费用。
健全内部控制制度
确保研究开发费用核算归集的真实、准确。企业应按月对包括直接研究开发活动和可以计入的间接研究开发活动所发生的费用进行归集，并填写企业年度研究开发费用结构明细表。对研究开发部门的各项费用建立账册，进行单核算。具体来讲应建立如下控制制度 。
建立外包制度
所有研发活动的外包合同经过研究开发项目负责人签署。财务部门依据经过签署的研发活动外包合同和对方提供的有效付款凭证，以及表明经过研究开发项目负责人签署的外包研发活动进展情况的验收确认单据付款，会计人员核对合同和付款单据后记账。研发机构对委托的外部研发投入和境内的外部研发支出在费用单据上进行标注，并经相关负责人审批。财务部门对委托的外部研发投入和境内的外部研发支出分别设立账户核算。所有的外包支付申请说明外包所属的研究开发项目名称、项目编号。财务部门依据研究开发项目名称、项目编号将外包费用计入相应的研究开发项目。
至于申报中需要多少个，说法不一。
总结有两种声音：
种：1个发明或5个实用新型 ；
第二种：15-18个。
认为只需要1个发明或5个实用新型即可申报高企的机构：让客户一下子申报十多个，就是在坑钱。
认为需要15-18个的机构：只拥有1个发明或5个实用新型就去申报，是对政策条件的肤浅认识，是在让客户冒险，看似给客户省钱，实际得不偿失。
认定申请应提交的材料主要包括几个部分：
1.认定申请书；
2. 企业营业执照副本、税务登记证（复印件）；
3. 知识产权证书（占许可合同）、生产批文，新产品或新技术（查新）材料、产品质量检验报告、省级以上科技计划立项，以及其他相关材料；
4. 企业职工人数、学历结构以及研发人员占企业职工的比例说明；
5. 经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用情况表（实际年限不足三年的按实际经营年限），并附研究开发活动说明材料；
6. 经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、损益表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）以及技术性收入的情况表。
以上材料仅供参考，具体请以实际申请要求为准。
申请要点
1、6个软件著作权或6个实用新型或1个发明。
2、企业需要提供三年内的12份销售合同。
3、企业需要提供近三年内，每年的年度审计报告。近三年的研发费用专项审计报告，高新收入专项审计报告。
4、提供公司人员名单及对应的研发人员、科技人员、人员名单，并提供相应人员的明复印件、劳务合同（岗位及支撑，没有就调整）、明复印件。
5、由技术人员配合调整技术材料，完善立项报告、研发文档等。
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