鉴定机构需要对检材和样本的字迹进行比较分析，制作《笔迹特征对比表》，对检材与样本字迹反映出的笔记特征的异同情况、变化范围、变化程度、变化形成原因等逐一分析比对。一般的比较方法有：直接目测比较、现为观察比较、用测量工具或软件进行测量比较、重合比较、运用统计学原理和方法进行异同情况的统计分析。
书写习惯本身具有特殊性和相对的稳定性。书写习惯的特定性表现在每个书写人的书写习惯体系是特定的，与其他人都不相同，一个人书写一定的文字手稿，在其反映出的书写动作、文字布局、书面语言三方面习惯中，有一部分习惯是很多人共有的，有一部分习惯是一部分人少有的、甚至是特有的，那些共有的、少有的、特有的书写习惯便构成各人书写习惯体系，是一习惯区别于另一习惯的本质。同时，书写习惯又有其相对的稳定性，其习惯体系能在一定时期内保持稳定而不发生根本的改变。书写习惯的相对稳定性是笔迹鉴定的一个不可缺少的条件。书写习惯体系可能受到主客观条件的影响而发生改变，如生理因素、心理因素、书写工具、以及个人可以伪装等，但从总的方面讲，在一定时期内，这些改变不会对鉴定造成根本性的影响。
每个人的书写习惯一经形成就很难改变，书写笔画、笔锋、笔力都可以体现出每一个人的特质。在民事诉讼中经常要对笔迹的同一性进行鉴定，但因送检材料的数量、质量等原因，不一定对所有的笔迹鉴定都能给出肯定性结论，也有根据检材与样本的具体情况做出倾向性鉴定意见。
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