为了获取有机认证，申请者需向美国农业部认可的认证机构提交申请。认证机构包括私营认证机构、国家认证机构或国际机构。申请应包括所有必要信息。
转换期是的。常规农场向有机农场转换需建立有效的管理体系，并停止使用化学合成农药、化肥后，经过特定过渡期才能正式认证为有机农场。转换期间，所有用于生产产品的土地至少需3年未使用禁用物质。期间不允许使用任何禁用物质。
认证费用因认证机构、操作场所类型、规模及复杂程度的不同，范围从几百美元到几千美元不等。通常包含申请费、年续期费、年度生产或销售评估费和检验费。
证书每年更新一次，认证机构收取换发新证费用及自认证以来的任何变更更新（包括有机体系计划）。认证机构会安排有资质的检验员访问农场或企业，验证是否遵守更新后的有机体系计划，保留适当的历史记录，并满足美国农业部有机法规的所有要求。检查通常提前安排，但有些检查事先不通知。检验员提交报告后，认证机构根据报告及有机体系计划做出认证决定。
认证范围**：美国的有机认证不于农产品，还包括食品、护肤品等多个品类。只要产品能够满足NOP的要求，均可以申请认证。 **认证等级与标识**：美国的有机农产品标识有四种，即有机、有机（有机成分含量大于95%）、有机制造（有机成分含量70%～95%）和含有机成分（有机成分含量小于70%）。不同等级的产品在标识使用上有不同的规定。
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