冷藏集装箱有外置式和内置式两种，温度可以在特定范围内调节。内置型集装箱在运输中可以自由启动制冷机，将集装箱保持在温度，另一方面，外置集装箱需要集装箱车、船、放置站所配备的制冷机。适合夏天运送黄油、巧克力、冷冻海鲜、炼乳等。
冷藏集装箱在冷却过程中经常发生故障，造成这种故障的原因很多。例如，冷藏集装箱在运行时设定的温度与人工实测的温度相同，但冷武箱温度记录表盘显示的温度和前者相差很大，表明温度感温探测器出现故障。虽然还有其他故障原因，但不管是什么原因，都要准备检查和维修。
冷藏集装箱脱离制冷时间：各种运输方式之间的交接可能出现短途运输或制冷系统故障，造成停止制冷。对冷冻和冷藏保鲜货物短时间地停止制冷状态是允许的。许多产品出现几小时的停止制冷可以接受，但并非所有货物都如此。对任何冷藏货物均不允许出现长时间地停止制冷。对特种货物和温度灵敏货物应保持制冷系统连续工作，避免任何温度波动造成货物质量下降。
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