分公司注册一般包括以下流程：
名称核准：
准备工作：确定分公司的名称，一般是在总公司名称后面加上 “分公司” 字样，如 “XX 公司赣州分公司”。但有些地区对分公司名称有特殊要求或限制，所以在取名前好先向当地市场监督管理部门咨询。
提交申请：可以通过线上或线下的方式向当地市场监督管理部门提交名称核准申请。线上的话，通常是登录当地政务服务网，按照系统提示填写相关信息；线下则需前往市场监督管理部门的办事窗口，提交《企业名称预先核准申请书》以及总公司的营业执照副本复印件等材料（具体要求各地可能会有所不同）。
审核结果：市场监督管理部门会对申请的名称进行审核，如果名称符合相关规定且不与已注册的企业名称重复，就会核准通过，发放《企业名称预先核准通知书》。
准备登记材料：
填写申请表：填写《分公司设立登记申请书》，申请书上需填写分公司的基本信息，如名称、经营范围、经营场所等，并由总公司加盖公章 。
相关证明文件：
总公司的营业执照副本原件及复印件（复印件需加盖总公司公章），用于证明总公司的主体资格。
总公司的公司章程（加盖公司公章），章程应是总公司新的章程，能够体现总公司的组织架构、股东权益等信息。
总公司出具的分公司负责人的任职文件及身份证件复印件，任职文件需明确分公司负责人的职责、任期等信息。
分公司营业场所的使用证明，包括房屋租赁合同、房产证明等。如果是租赁的场所，租赁合同应明确租赁期限、租金等信息；如果是自有房产，则需提供房产证明。
法律、行政法规和决定规定设立分公司报经批准的，还需提交有关的批准文件或者许可证书复印件 。
提交申请材料：
线上提交：如果当地支持线上办理，就登录政务服务网，按照系统提示上传准备好的申请材料。上传时要确保材料的清晰度和完整性，上传成功后提交申请。
线下提交：将准备好的申请材料带到当地市场监督管理部门的办事窗口，交给工作人员进行审核。如果材料有缺失或不符合要求，工作人员会当场告知，需要补充或修改后重新提交。
审核与审批：
初步审查：市场监督管理部门会对提交的申请材料进行初步审查，主要检查材料是否、是否符合法定形式等。如果材料存在问题，会通知申请人补充或修改；如果材料符合要求，会进入下一步审查。
实质审查：对于一些涉及特殊行业或特殊经营范围的分公司，市场监督管理部门可能会进行实质审查，如对经营场所进行实地核查、对申请的经营范围进行审核等。
审批决定：经过审查后，市场监督管理部门会作出审批决定。如果批准设立，会核发分公司的营业执照；如果不予批准，会书面通知申请人并说明理由 。
领取营业执照：
领取方式：申请人可以根据市场监督管理部门的通知，选择到办事窗口领取营业执照，或者申请通过邮寄的方式获取 。
核对信息：领取营业执照后，要仔细核对营业执照上的信息，包括分公司的名称、经营范围、经营场所、负责人等，确保信息准确无误。
刻制印章：
申请刻章：凭营业执照，到的刻章处申请刻制分公司的印章，包括公章、财务章、负责人章等。有些地区还可以通过线上平台申请刻章，具体操作方式可咨询当地公安部门或刻章机构。
提交材料：通常需要提交营业执照副本原件及复印件、法定代表人身份证原件及复印件、刻章申请书等材料（具体要求各地可能会有所不同）。
领取印章：经过审核后，刻章机构会刻制印章，并通知申请人领取。领取时要仔细检查印章的质量和内容是否正确。
办理其他相关手续：
办理组织机构代码证：如果当地还有组织机构代码证的要求，可以携带营业执照副本原件及复印件、法定代表人身份证原件及复印件、分公司负责人身份证原件及复印件等材料，到当地质量技术监督部门办理组织机构代码证 。
办理税务登记证：在营业执照颁发后的规定时间内（一般为 30 日内），携带营业执照副本原件及复印件、组织机构代码证副本原件及复印件、法定代表人身份证原件及复印件、分公司负责人身份证原件及复印件、经营场所证明等材料，到当地税务部门办理税务登记证 。
银行开户：选择一家合适的银行，携带营业执照副本原件及复印件、组织机构代码证副本原件及复印件、税务登记证副本原件及复印件、法定代表人身份证原件及复印件、分公司负责人身份证原件及复印件、公章、财务章、负责人章等材料，到银行申请开立基本账户 。
分公司不办理税务登记可能会产生以下后果：
行政处罚方面：
责令限期改正：税务机关发现分公司未办理税务登记后，会在发现之日起 3 日内责令其限期改正。
罚款：如果分公司逾期仍不改正，税务机关可对其处以 2000 元以下的罚款；情节严重的，处 2000 元以上 10000 元以下的罚款。
经营受限方面：
发票领用受限：没有办理税务登记，分公司无法正常领用发票，这将严重影响分公司的日常经营活动，如无法给客户开具发票，可能会导致业务合作受阻，客户流失。
影响业务开展：在一些业务合作中，合作方可能会要求分公司提供税务登记证明等相关文件，若分公司无法提供，可能会失去合作机会。
后续手续办理困难：
注销障碍：如果分公司后续想要注销，未办理税务登记会使注销手续变得复杂且困难。在办理注销税务登记时，需要先结清税款、滞纳金、罚款等，然后才能完成注销手续。如果之前未办理税务登记，这些问题的处理会耗费更多的时间和精力。
变更手续受阻：如果分公司的经营信息发生变更，如经营范围、经营地址、负责人等，由于未办理税务登记，相关的变更手续也无法正常办理。
信用影响方面：
影响总公司信用：分公司作为总公司的分支机构，其行为可能会对总公司的信用产生影响。分公司不办理税务登记的不良记录可能会影响总公司的信用评级，进而影响总公司的融资、投标等经济活动。
负责人信用受损：分公司的负责人可能会因为分公司未办理税务登记的行为而受到信用影响，如被列入税务部门的失信名单，这将对其个人的信用记录产生不良影响，在办理贷款、购房、乘坐飞机高铁等交通工具时可能会受到限制。
法律责任方面：如果分公司长期不办理税务登记且存在严重的逃税、漏税等违法行为，可能会面临更严重的法律责任，相关责任人甚至可能会被追究刑事责任。
分公司在网上注册后，通常还需要办理以下手续：
刻章备案：
凭营业执照，到公安机关的刻章点办理分公司的公章、财务章、负责人章、发票章等印章。不同地区对于刻章的具体要求和流程可能会有所不同，但一般需要提供营业执照副本、法定代表人身份证明等材料。刻章完成后，要对印章进行备案，以便日后管理和使用。
银行开户：
选择合适的银行，携带营业执照正副本、法定代表人身份证、分公司负责人身份证、公章、财务章等材料，去银行申请开立基本账户 。基本账户是分公司进行日常资金收付和结算的主要账户，对于分公司的资金管理非常重要。每个银行的开户要求和流程可能会有差异，建议提前咨询银行了解具体情况。
税务登记：
前往分公司所在地的税务机关办理税务登记手续。需要提供总公司工商营业执照复印件、分公司营业执照复印件、办公场所证明及租赁合同、总公司章程、组织机构代码证复印件、总公司国税及地税税务登记证复印件、负责人身份证原件及复印件、经办人身份证原件及复印件等材料（具体要求各地可能会有所不同）。办理税务登记后，税务机关会根据分公司的经营范围和实际情况，核定相关税种和纳税申报期限等。
社会保险登记：
如果分公司需要招聘员工，应当按照当地规定，在社保经办机构办理社会保险登记手续。需要提供营业执照、组织机构代码证、法定代表人身份证明、员工身份证等材料，为员工缴纳社会保险费，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险。
其他备案或审批手续：
根据分公司的具体经营范围，如果涉及到特殊行业或需要特殊审批的项目，还需要办理相关的备案或审批手续。例如，从事食品销售的分公司需要办理食品经营许可证，从事建筑施工的分公司需要办理相关的建筑资质证书等。
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