招标代理结构的立性差同时也极易促成代理机构、招标方与投标方三者之间相互勾结，影响甚至操纵招投标结果的不利局面。在对招标代理机构进行审计时，审计人员应对代理机构、招标方与投标方三者之间的往来和关系进行审查。
一些资质不符合招标要求的投标方为了参与招投标活动，甚至终取得项目的中标，不惜违规借用符合条件的资质证明材料、以他人名义投标或虚报业绩来欺骗招标方，获得投标资格，骗取中标。如果这类投标方后中标，势必会引起其他投标方的不满，甚至投诉，后导致招标方与中标方接受部门的审查，轻则此次招标无效，重则依法追究刑事责任，对招标方、投标方等各单位都会产生严重的不良影响。因此，审计人员在审计过程中更应着重注意审查投标方资质是否满足招标文件中所列示的要求。
在招标活动中，投标方为了后中标，一般会采取串标、陪标等方式来骗取中标。常见手段有：一是由于招标方与某一投标方之间存在某种利害关系，招标方会通过泄漏标底、串通等形式与投标方串标，以帮助投标方中标获得承建资格。
招标准备工作审计。充分的招标准备工作是做好招投标工作的一个前提。对招标准备阶段的审计，应审查招标项目的审批手续、资金落实情况，同时审查招标所采用的形式，是公开招标还是邀请招标;审查招标内容的合规性、合法性以及与招标方式相关规定的一致性。
一是程序规范化。审计招标严格按照相应的招标程序来选择与购买审计服务，审计服务需求方及招标方依照一定程序将其所需审计服务的内容以及相关条件等信息公开，满足条件的会计师事务所发起投标。 二是竞争性。审计服务需求方通过将其所需审计服务的内容以及相关要求公开来吸引会计师事务所，招标公示将很多招标信息提供给会计师事务所，使得会计师事务所能够公平地参与审计投标中来。 三是招标过程公正公平公开。
资产负债表审计 审查内容有∶ （1）检查资产负债表是否按照会计制度规定的科目及格式编制，复算报表各项之间的钩稽关系。 （2）将本期资产负债表各项目数字与期或各期相比，查明有无变动较大或异常情况;同时，检查资产负债表与其他报表的钩稽关系，并进行复算核对。 （3）全面核对资产负债表项目与总帐科目或有关明细帐数字是否相符，以总帐的本期发生额及余额与其所属明细账各分类科目的本期发生额及余额之和相核对，检查帐与帐之间的记录是否相符。 2、损益表审计 需审查内容有∶ （1）检查损益表内各项目填列是否完整，有无漏填、错填;核对各项目数字之间的钩稽关系。 （2）检查损益表与其他报表的勾稽关系。 （3）核对损益表各项目数字与相关的总账、明细账数字是否相符。 （4）结合对成本费用、销售收入、利润分配等有关明细账的检查，核实成本费用、各项收入、投资收益和营业外收支等项教字是否准确 （5）结合对纳税调整的检查，核实所得税的计算是否正确，
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