高企申报需要提交下列申请材料：
1、高新技术企业认定申请书；
2、企业营业执照副本、税务登记证（复印件）；
3、知识产权证书（占许可合同）、生产批文，新产品或新技术证明（查新）材料、产品质量检验报告、省级以上科技计划立项证明，以及其他相关证明材料；
4、企业职工人数、学历结构以及研发人员占企业职工的比例说明；
5、经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用情况表（实际年限不足三年的按实际经营年限），并附研究开发活动说明材料；
6、经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、损益表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）以及技术性收入的情况表。
认定管理办法
总 则
条 为扶持和鼓励发展，根据《共和国企业所得税法》(以下称《企业所得税法》)、《共和国企业所得税法实施条例》(以下称《实施条例》)有关规定，特制定本办法。
第二条 本办法所称的是指:在《国家支持的高新技术领域》内，持续进行研究开发与技术成果转化，形成企业核心自主知识产权，并以此为基础开展经营活动，在中国境内(不包括港、澳、台地区)注册的居民企业。
第三条 认定管理工作应遵循企体、鼓励技术创新、实施动态管理、坚持公平公正的原则。
第四条 依据本办法认定的，可依照《企业所得税法》及其《实施条例》、《共和国税收征收管理法》(以下称《税收征管法》)及《共和国税收征收管理法实施细则》(以下称《实施细则》)等有关规定，申报享受税收优惠政策。
第五条 、财政部、税务总局负责全国认定工作的、管理和监督。
第二章 组织与实施
第六条 、财政部、税务总局组成全国认定管理工作小组(以下称"小组")，其主要职责为:
(一)确定全国认定管理工作方向，审议认定管理工作报告;
(二)协调、解决认定管理及相关政策落实中的重大问题;
(三)裁决认定管理事项中的重大争议，监督、检查各地区认定管理工作，对发现的问题整改。
第七条 小组下设办公室，由、财政部、税务总局相关人员组成，办公室设在，其主要职责为:
(一)提交认定管理工作报告，研究提出政策完善建议;
(二)各地区认定管理工作，组织开展对认定管理工作的监督检查，对发现的问题提出整改处理建议;
(三)负责各地区认定工作的备案管理，公布认定的名单，核发证书编号;
(四)建设并管理"认定管理工作网";
(五)完成小组交办的其他工作。
研发费用直接投入核算2.1核算难点 《工作指引》中较明确规定了直接投入的开支范围，但企业实际发生的研发费中的材料费品种繁多，部分领料单上亦未写明具体用于什么研究开发项目，直接投入的认定和分配缺乏可靠的依据。
此外，很多申报企业特别是中小型企业以前年度并没有立设置研发费用科目，发生的研发费分别记载于不同的会计科目，如实验车间成本、管理费用、其他业务支出、在建工程、专项应付款等，而不同会计科目之间又不存在对申报明细表而言的勾稽关系。因此，申报企业将非研发材料成本计入研发直接投入中的人为操作空间很大。2.2应对措施a.总量领用的合理性判断； b.研究开发材料领用的月均波动情况是否合理； c.领用材料与研究开发项目的相关性判断，必要时可以考虑利用外部工作。如：聘请行业，对研究开发项目有关直接投入的品种、数量、质量等因素的合理性、相关性进行评价； d.对研究开发材料所形成的实物成果进行盘点及残次品的销售进行综合判断。如：电缆生产企业研究开发项目领用的铜等重要材料，在考虑残次品销售的前提下，需要对期末实物库存的合理性进行判断。
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