原始自然堆沤发酵，此种方法缺点比较多：
1. 发酵持续时间长，大约要在300天以上，延迟了羊粪的使用吋间，而且大量占用土地， 造成土地资源浪费；
2. 堆沤的过程中造成污染，
其气污染.堆沤过程中，发酵期间会出现恶臭味， 一方面影响大气质量，对周边大 气造成污染，另一方面影响周边居民生活环境，危害身体健康。
其二水体污染.羊粪堆沤发酵过程中产生的各种有害病菌易随地表水流入地下水源，造成地表水和地下水双层污染，对工农业生产都会造成危害。
其三环境污染.堆沤过程中，促使蚊蝇滋生，传播疾病，对人类生活特别不利。
在选择羊粪的时候，大家一定要注意一下羊粪的来源，因为有些羊粪是直接从养殖场运回来的，这种羊粪是饲料味的羊排出来的，相比草原上的羊粪而言，它里面可能含有重金属或者碱性太强，用来养花效果不是特别好；尤其是用它来种菜不安全，所以一般买羊粪的时候，要注意一下它的来源，从大草原上运作来的羊粪，相对安全。
有时候大家在购买羊粪的时候，会选择一些比较干燥的羊粪，因为这种羊粪的重量比较轻，便于携带，而且价格相对也比较低，其实干燥的羊粪并没有湿润的羊粪好，因为羊粪里面的有机质含量比较高，如果肥料太过干燥，里面的一些菌群就会死掉，这样埋到花盆里面，只能起到补肥的效果，不能起到改善土质的效果。
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