科研院所申请进出口权须履行以下程序：各部门直属科研院所应向其主管部门提出书面申请，由主管部门送科技部和外经贸部；地方科研院所向所在省、自治区、直辖市及计划单列市经贸厅（委）和科委提出书面申请，由经贸厅（委）和科委负责审查，取得一致意见后联合报科技部和外经贸部。科技部对各部门、各地区报送的科研院所进行审查后，提出审查意见分批送外经贸部，外经贸部根据科技部的审查意见，进行审核批复。
部门直属企业及沿海地区物资企业、商业批发企业年销售额在10亿元人民币以上，内地物资企业、商业批发企业年销售额在3亿元人民币以上；
可以直接从事自营进出口业务。
在批准的进出口业务范围内，可以经营该企业或院所自产产品的出口业务，经营该企业或院所生产、科研所需的机械设备、零配件、原辅材料的进口业务。
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