冷藏集装箱除了货物的设定值和送风、回风温度外，温度控制系统还会以错误代码的形式提供有关系统问题的详细信息。货物温度可通过美国农业部（USDA）探测仪记录，安装该探测仪是为了符合美国农业部针对水果的运输的冷藏处理程序。托运人放置于所载货物中的数据记录仪也会记录大体温度。当冷藏装置失灵时，温度显示和数据记录将会展示一个逐渐稳定的温度上升直至终达到周围环境温度值过程。再次强调，感应器只会记录空气温度，而非货物温度。货物将会受到周围绝热材料一定的保护，防止受到外部空气温度的影响。
通常，冷藏货物可以分成两种：冷藏和冷冻
许多冷藏货物（例如水果）被视为是“活性（live）”货物，因为其在采摘过后仍然能够进行呼吸并且由于自热、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他条件而容易腐烂。然而，其它商品比如冷藏肉/鱼类和奶酪则并非如此。水果的低设定温度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷冻货物通常被认为是“惰性(inert)”货物，一般在-18℃（0°F）或更低温度下运载。既然冷藏和冷冻货物都是易腐烂的，注意确保这类货物以佳状态交付。对于冷藏货物，除了有限的几种例外情况（比如肉，巧克力，胶片，化学物品，奶制品，人工气调储藏运输货物）外，其通风设备通常要保持开启状态。一些货物可能要求湿度控制或者大量的新鲜空气（比如球茎花卉）。应当注意大多数冷冻装置仅能够减少湿度，并且这取决于所提供的新鲜空气的数量。人工气调储藏运输的货物需要使用能够利用氮和二氧化碳替代氧气水平的用途的集装箱，来延长已采摘的产品的保质期。这种方法适用于许多有核和无核水果，但要求具备的知识来确定适宜的气体浓度水平。
随着冷藏集装箱生产的发展和应用的普及，冷藏集装箱的研究领域十分广阔，
1、对冷藏集装箱结构的研究，使箱体具有更高的强度、刚度、隔热性能和通风系统。
2、冷藏集装箱性能研究采用多方向、多控制参数的电子控制，采用微机及相应的电子元件对箱内空气的温度、湿度、空气质量等参数进行综合处理，实现跟踪，箱内空气参数的调节和控制。研究一种新的“新鲜空气交换系统”，以可靠地监测箱内的空气成分，有害气体，补充新鲜空气，调节空气湿度，实现更有效的食品保存。
3、冷藏集装箱制冷装置的研究：制冷装置在计算机的控制下工作，制冷压缩机根据微机发出的热负荷信号自动调节速度和制冷量，使冰箱保持在工作状态。
4.为了执行有关保护大气臭氧层的协议，有必要开展冷藏容器制冷剂更换的研究。
5、冷藏集装箱热性能测试系统软件设计有待进一步优化。
6、冷藏集装箱仿真研究。
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