经过内审和管理评审，组织如果确认其环境管理体系基本符合ISO14001标准要求，对组织适用性较好，且运行充分、有效，可向已获得中国环境管理体系认证机构认可认可有认证资格的认证机构提出认证申请并签定认证合同，进入ISO14001环境管理体系认证审核阶段。
为接受认证机构的认证审核，组织应做好充分准备，保持体系有效运行。认证机构会派出审核组，审核组将对组织实施认证审核。认证审核包括阶段审核和第二阶段现场审核。在组织完成第二阶段现场审核开具的不符合纠正并经过审核组验证关闭后，机构经过认证评定，将确定是否批准组织的认证注册和颁发认证证书。认证证书有效期三年，三年内，组织要多次接受机构的监督审核；三年后，组织要申请复审，重新注册获得证书，此过程同次认证取证。
本标准适用于任何有下列愿望的组织：
a) 建立、实施、保持并改进环境管理体系；
b) 使自己确信能符合所声明的环境方针；
c) 通过下列方式展示对本标准的符合；
1） 进行自我评价和自我声明；
2） 寻求组织的相关方（如顾客）对其符合性予以确认；
3） 寻求外部对它的自我声明予以确认；
4） 寻求外部组织对其环境管理进行认证/注册。 本标准规定的所有要求都能纳入任何一个环境管理。其应用程度取决于诸如组织的环境方针、它的活动、产品和服务的性质、以及它的运行场所及条件等因素。本标准还在附录A中对如何使用本标准提供了资料性的指南。
ISO 14000系列标准归根结底是一套管理性质的标准。它是工业发达国家环境管理经验的结晶，在制定国家标准时又考虑了不同国家的情况，尽量使标准能普遍适用。
·ISO 14001标准对企业的积极影响主要体现在以下几个方面：
·树立企业形象，提高企业的度
·促使企业自觉遵守环境法律、法规
·促使企业在其生产、经营、服务及其他活动中考虑其对环境的影响，减少环境负荷
·使企业获得进入国际市场的“绿色通行证”
·增强企业员工的环境意识
·促使企业节约能源，再生利用废弃物，降低经营成本
·促使企业加强环境管理
通过环境管理体系认证给组织带来的益处
-满足法律要求，获取国际贸易的"绿色通行证-增强企业竞争力，扩大市场份额
-树立企业形象
-改进产品性能，制造"绿色产品-改革工艺设备，优化成本，实现节能降耗
-污染预防，环境保护
-避免因环境问题所造成的经济损失
-提高员工环保素质
-提高企业内部管理水平，降低管理成本减少环境风险，实现企业永续经营
在实际操作中，实施ISO14001环境管理体系认证也有许多具体的步骤和方法。，企业需要了解并分析自身的环境因素，找出需要控制和改进的地方。其次，企业需要制定详细的环境管理计划和实施方案，明确责任和分工再次，企业需要定期进行环保检查和评估，确保环境管理体系的有效运行。后，企业还需要与认证机构合作，按照审核标准进行自查和整改，以达到认证要求。
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