市、县级人民食品药品监督管理部门对化妆品生产企业进行监督检查的主要内容包括：
（一）生产企业是否具有合法的《化妆品生产许可证》并按许可事项进行生产；
（二）生产企业的生产条件是否持续符合许可事项的要求；
（三）生产企业是否存在质量安全风险；
（四）其他化妆品相关法律、法规的要求。
企业应建立与生产规模和产品结构相适应的质量管理体系，将化妆品生产和质量的要求贯彻到化妆品原料采购、生产、检验、储存和销售的全过程中，确保产品符合标准要求。 综合判断:检查完条款所有内容后判断是否建立了文件化体系，且按照文件化体系有效运行，不断检查、改进系统。
企业应制定质量方针，质量方针应包括对满足要求和持续改进质量管理体系有效性的承诺，且得到沟通。
企业应制定符合质量管理要求的质量目标，质量目标应是可测量的，并且与质量方针保持一致，且分解到各个部门。
企业应制定评审方针并定期检讨质量目标的完成情况，质量目标的实现。 检查企业是否制定质量方针，是否涵盖要求。
检查企业是否制定质量目标，是否涵盖要求。
抽查部分管理层，检查是否了解质量方针以及企业的目标。
查质量方针是否定期评审。
抽查1—2个目标，看是否定期检讨质量目标的完成情况。
企业应制定完善的质量管理制度，质量管理制度应至少包括：
13.1 文件管理制度；
13.2 物料供应管理制度；
13.3 检验管理制度；
13.4 放行管理制度；
13.5 设施设备管理制度；
13.6 生产工艺管理制度；
13.7 卫生管理制度；
13.8 留样管理制度；
13.9 内部检查制度；
13.10 追溯管理制度；
13.11 不合格品管理制度；
13.12.投诉与召回管理制度；
13.13.不良反应监测报告制度。
实验室应按检验需要建立相应的功能间，包括微生物检验室、理化检验室。微生物检验室的环境控制条件应能确保检测结果准确可靠。 检查实验室是否按检验需要设立相应的功能间；询问如何微生物实验室环境条件满足要求，进行评判。
化妆品生产许可证办理是需要依据国家食品药品监督管理局的相关规定进行的。一般的办理流程如下：
1. 准备相关材料：包括企业营业执照、组织机构代码证、生产车间布局图、生产工艺流程图、产品配方和质量标准等相关资料。
2. 填写申请表格：根据当地食品药品监管部门的要求，填写化妆品生产许可证申请表格，并附上相关材料。
3. 提交申请材料：将填写好的申请表格和相关资料提交给当地食品药品监管部门，并缴纳相应的申请费用。
4. 审核和验收：监管部门对提交的申请材料进行审核，包括对企业生产条件和质量管理体系的审核，还会进行现场检查和验收。
5. 颁发许可证：通过审核合格后，监管部门会颁发化妆品生产许可证，企业方可开始生产销售化妆品。
需要注意的是，不同地区的具体办理流程和申请要求可能有所差异，建议在办理前先向当地食品药品监管部门咨询，了解详细的办理流程和所需材料。
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