冷藏集装箱的基本类型有保温集装箱、外置冷藏集装箱、内置冷藏集装箱、液氮和干冰冷藏集装箱、冷冻板冷藏集装箱等。冷藏集装箱运输冻结货物时，通常使用-18℃以下的温度。通常为英尺冷冻集装箱，平均降温速度为31.3℃/h（空箱），但装运货物后，由于货物热容大，降温速度会大幅减速，可能需要15-16h才能达到设定温度要求。采购温度高的情况下，达到设定温度需要2-3d。
除了冷藏集装箱货物的设定值以及送风和回风的温度之外，温度控制系统还以错误代码的形式提供有关系统问题的详细信息。美国农业部检测器可以记录货物的温度，该检测器的安装符合美国农业部水果运输的冷藏处理程序。托运人放置在货物中的数据记录器也将记录一般温度。当制冷装置出现故障时，温度显示和数据记录会显示一个逐渐稳定升温直至达到环境温度值的过程。同样，传感器只记录空气温度，不记录货物温度。货物将受到周围隔热材料的保护，以防止它们受到外部空气温度的影响。
冷藏集装箱采用镀锌钢结构，箱内壁、底板、顶板和门由金属复合板、铝板、不锈钢板或聚酯制造。具有装卸灵活、货物运输温度稳定，货物污染、损失低，适用于多种运载工具，装卸速度快，运输时间短，运输费用低。按照运输方式冷藏集装箱可分为海运和陆运两种。
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