冷藏集装箱货物的设定值以及送风和回风的温度之外，温度控制系统还以错误代码的形式提供有关系统问题的详细信息。美国农业部检测器可以记录货物的温度，该检测器的安装符合美国农业部水果运输的冷藏处理程序。托运人放置在货物中的数据记录器也将记录一般温度。
为了解决集装箱进出口不平衡的问题，船公司通常要向出口大于进口的地区调拨大量空箱。由于空箱的调拨要增加大量调拨成本，船公司在空箱调拨进口至空箱装货出口的过程中更应加强集装箱管理，避免超期箱的出现。在集装箱运输中空箱由进口到出口的整个流程可以归结如下：
冷藏集装箱船舶进港→空箱卸船→码头堆存→集装箱车队拖箱→空箱进堆场→发货人提箱→装箱→重箱进港区→装船。
冷藏集装箱的陆上运输工具中有温控集装箱的水运交通工具，以及运用更高运速的空中运输工具。但是用户在选择以上三种运输方式的时候，还应该仔细去考虑冷藏运输多少钱这个问题，因为只有在不断的对比和分析当中，才能选择出适合自身的冷藏运输方式。
二手冷藏集装箱：不同的货品对厢体都有不同的要求。如，运送鲜肉的冷藏车需要在厢体上定制挂钩。在平均3—4 天的运送耗时下，冷链物流成为必然趋势。为门店做配送的冷藏车，由于货物批量小，品种多，需要多温层冷藏车，对温度需求不一，装卸频繁的货物，则需要多开门冷藏车。随着科学技术的进步，低温制冷技术的发展而建立起来，食品冷藏链是指易腐食品再生产，贮藏，运输，销售，消费前的各个环节中始终处于规定的低温环境下。
冷冻集装箱工作温度在-28℃~ 26℃之间，根据货种的需要，可自动调节是箱内温度不变。保温集装箱适宜装运对温湿度敏感的货物。保温集装箱主要用于装载水果、蔬菜等鲜货。一般用干冰等冷剂防止箱内温度过度上升，通常的保温时间为72小时左右。箱内四周和上下都有充分的防热构造。
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